RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A4P12235 298 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRB-208ENST00000550358 TXNDC17Q9BRA2 123 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 OR2D2Q9H210 308 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRB-208ENST00000550358 Q3ZCU0 254 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRB-208ENST00000550358 J3QR89 54 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRB-208ENST00000550358 SIAH2O43255 324 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 ACP1P24666 158 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 GZMMP51124 257 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF273Q14593 569 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 RPEL1Q2QD12 228 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 SAP25Q8TEE9 199 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 RNF122Q9H9V4 155 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 RGS13O14921 159 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 DEDDO75618 318 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 LYZL6O75951 148 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 ISG15P05161 165 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 ASAH2BP0C7U1 165 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-208ENST00000550358 COX6B1P14854 86 aa7.47□□□□□ -1.21
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