RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533235.5

SLC43A3-223, Transcript of solute carrier family 43 member 3, human

TSL 5

Gene SLC43A3, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC43A3-223	ENST00000533235	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	TMEM212	A6NML5	194 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	SULT1B1	O43704	296 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	OCM2	P0CE71	109 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	LIMS3	P0CW19	117 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	LIMS4	P0CW20	117 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	KIR2DS4	P43632	304 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	RAB13	P51153	203 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	IL18R1	Q13478	541 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	FAM189A2	Q15884	450 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	SSX2	Q16385	188 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235		Q96MT0	163 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	NEK6	Q9HC98	313 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	RAB18	Q9NP72	206 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SLC43A3-223	ENST00000533235		A6NDX4	124 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	HCK	P08631	526 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	CCDC159	P0C7I6	412 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	LMO1	P25800	156 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	HERPUD1	Q15011	391 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	LPCAT4	Q643R3	524 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	XAF1	Q6GPH4	301 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235		Q6P435	159 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	MALSU1	Q96EH3	234 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	JAM3	Q9BX67	310 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZNF702P	Q9H963	129 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	DHDH	Q9UQ10	334 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	EBAG9	O00559	213 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	SH2D1B	O14796	132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	ALX3	O95076	343 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZNF44	P15621	663 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	GDNF	P39905	211 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	GLIPR1	P48060	266 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	AES	Q08117	197 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	CDK5R1	Q15078	307 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	KISS1	Q15726	138 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZSCAN26	Q16670	478 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	C11orf88	Q6PI97	169 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	CFHR4	Q92496	578 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	COQ2	Q96H96	371 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	RHOF	Q9HBH0	211 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	PLXNB1	O43157	2135 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235		A0A0G2JK05	382 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	FAM172BP	A6NC97	362 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	GABRP	O00591	440 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	CLIC3	O95833	236 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	CSN2	P05814	226 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	ETV1	P50549	477 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	DYNLT3	P51808	116 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZNF691	Q5VV52	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZNF529	Q6P280	563 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235		Q8N2B8	174 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SLC43A3-223	ENST00000533235	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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