RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519703.2

LINC01170-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1170, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC01170, Length 406 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01170-201ENST00000519703 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 A0A0A6YYJ9 748 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 hADV38S2A0JD32 116 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 TMEM82A0PJX8 343 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 MEIOCA2RUB1 952 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 BTBD17A6NE02 478 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 M0R1W7 72 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 LCE2BO14633 110 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 MGST3O14880 152 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 ALX3O95076 343 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 IGHV1-69P01742 117 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 CCL3L1P16619 93 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 HILS1P60008 231 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 ZP1P60852 638 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 GPR50Q13585 617 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 DOC2BQ14184 412 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 PIGYQ3MUY2 71 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 RNLSQ5VYX0 342 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 OSR2Q8N2R0 312 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 SLC25A28Q96A46 364 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 ZNF714Q96N38 554 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 DERL3Q96Q80 235 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 MGLLQ99685 303 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 MDFIQ99750 246 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 C19orf24Q9BVV8 132 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 DUSP21Q9H596 190 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 RHOFQ9HBH0 211 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 MEGF11A6BM72 1044 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 NPFFO15130 113 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 PSPNO60542 156 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 ZNF737O75373 536 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 ARL6IP5O75915 188 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 ALDOBP05062 364 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 CRYBA1P05813 215 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 ZNF728P0DKX0 622 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 GTF2F2P13984 249 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 MMP9P14780 707 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 FSTP19883 344 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 GLP1RP43220 463 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 BPIFB3P59826 476 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 ERVFRD-1P60508 538 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 GABARAPL2P60520 117 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 AESQ08117 197 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 ACSM1Q08AH1 577 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 GPR176Q14439 515 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 ZNF273Q14593 569 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 IRF3Q14653 427 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 ZNF146Q15072 292 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 TRAM1Q15629 374 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 PNKDQ8N490 385 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 CHST4Q8NCG5 386 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC01170-201ENST00000519703 PXT1Q8NFP0 134 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms