RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCGB1C2P0DMR2 95 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 MSR1P21757 451 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPEL1Q2QD12 228 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSDL1Q3SXM5 330 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 C2orf91Q6ZV80 131 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 JAGN1Q8N5M9 183 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR11G2Q8NGC1 345 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCGB1C1Q8TD33 95 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 C20orf24Q9BUV8 137 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 VCX3AQ9NNX9 186 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNIP2Q9NS61 270 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 BTRCQ9Y297 605 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR51B2Q9Y5P1 312 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 USH1CQ9Y6N9 552 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUMA1Q14980 2115 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A0B4J2E0 115 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 HEATR9A2RTY3 570 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGTP01019 485 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNTFRP26992 372 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAP1GDS1P52306 607 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTC32Q5I0X7 151 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLLU1OSQ5K130 101 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM215Q68D42 235 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 LAIR2Q6ISS4 152 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR5T3Q8NGG3 340 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR56A4Q8NGH8 313 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDNFQ8TB73 568 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGMATQ9BSE5 352 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYH11P35749 1972 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 A8MWP6 167 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTTG1O95997 202 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 FTH1P02794 183 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 NBL1P41271 181 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF117Q03924 483 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF404Q494X3 552 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q6ZTI0 123 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM9BQ8IZU0 186 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCNYL1Q8N7R7 359 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR10Z1Q8NGY1 313 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 CMBLQ96DG6 245 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAPBPLQ9BX59 468 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ULBP1Q9BZM6 244 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRO2289Q9P1D8 64 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 CACNG3O60359 315 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 SOD3P08294 240 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT16P08779 473 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATF1P18846 271 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPAM1P38567 509 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 SKP2Q13309 424 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 APOFQ13790 326 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 NNATQ16517 81 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM229BQ4G0N7 80 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZCWPW2Q504Y3 356 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 VTCN1Q7Z7D3 282 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR2M3Q8NG83 312 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 C8orf44Q96CB5 159 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 CPB2Q96IY4 423 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANAPC13Q9BS18 74 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR51B5Q9H339 312 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANKRA2Q9H9E1 313 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 PSMD13Q9UNM6 376 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 AP3M1Q9Y2T2 418 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 COL18A1P39060 1754 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZW10O43264 779 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF13O43567 381 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 MPDU1O75352 247 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 HLA-HP01893 362 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1QCP02747 245 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 GFAPP14136 432 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 DESP17661 470 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL12BP29460 328 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARL2P36404 184 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 RELAQ04206 551 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGTRAPQ6RW13 159 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 DAW1Q8N136 415 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITFG1Q8TB96 612 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 TCP10LQ8TDR4 215 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q96M85 177 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 MBOAT7Q96N66 472 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 METTL26Q96S19 204 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMED9Q9BVK6 235 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 PECRQ9BY49 303 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms