RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 GLAP06280 429 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB5CP51148 216 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-221ENST00000511747 HERV-K104P61576 105 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-221ENST00000511747 CEACAM16Q2WEN9 425 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-221ENST00000511747 CALHM1Q8IU99 346 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-221ENST00000511747 C20orf24Q9BUV8 137 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-221ENST00000511747 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-221ENST00000511747 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-221ENST00000511747 CXCL13O43927 109 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-221ENST00000511747 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF44P15621 663 aa23.38■■□□□ 1.33
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SH3BP2-221ENST00000511747 SRD5A2P31213 254 aa23.38■■□□□ 1.33
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SH3BP2-221ENST00000511747 CDCP2Q5VXM1 449 aa23.38■■□□□ 1.33
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SH3BP2-221ENST00000511747 BATF2Q8N1L9 274 aa23.38■■□□□ 1.33
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF587BE7ETH6 402 aa23.36■■□□□ 1.33
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SH3BP2-221ENST00000511747 TGIF1Q15583 401 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC25A26Q70HW3 274 aa23.36■■□□□ 1.33
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SH3BP2-221ENST00000511747 OR10D3Q8NH80 312 aa23.35■■□□□ 1.33
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SH3BP2-221ENST00000511747 NKX2-6A6NCS4 301 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-221ENST00000511747 C5orf52A6NGY3 159 aa23.34■■□□□ 1.33
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SH3BP2-221ENST00000511747 OR2C3Q8N628 320 aa23.34■■□□□ 1.33
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SH3BP2-221ENST00000511747 CDS2O95674 445 aa23.33■■□□□ 1.33
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SH3BP2-221ENST00000511747 A6NLC8 198 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 FOLR3P41439 243 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 CLINT1Q14677 625 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 SUMF1Q8NBK3 374 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-221ENST00000511747 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
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SH3BP2-221ENST00000511747 ADGRG7Q96K78 797 aa23.32■■□□□ 1.32
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