RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495702.5

CEP41-215, Transcript of centrosomal protein 41, human

TSL 1 (best)

Gene CEP41, Length 733 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP41-215	ENST00000495702	MUC7	Q8TAX7	377 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF596	Q8TC21	504 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	DUX3	Q96PT4	197 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	P2RX4	Q99571	388 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	SPATA25	Q9BR10	227 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	5.38	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	FAM172BP	A6NC97	362 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702		M0QZK8	103 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	CCL24	O00175	119 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	DHRS3	O75911	302 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	IGLV3-1	P01715	115 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	HMGN1	P05114	100 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	FAM106CP	P0CH98	169 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	GABRR1	P24046	479 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	MPZ	P25189	248 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	DUSP1	P28562	367 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	SLC6A1	P30531	599 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	CEACAM3	P40198	252 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	MNDA	P41218	407 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	OR3A4P	P47883	348 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	PRRX1	P54821	245 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	BDH1	Q02338	343 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	ROM1	Q03395	351 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	IL24	Q13007	206 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	HNF4G	Q14541	408 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	GINS1	Q14691	196 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	SNAPC1	Q16533	368 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	OR52W1	Q6IF63	320 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	TCF23	Q7RTU1	214 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF695	Q8IW36	515 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	NUDT11	Q96G61	164 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	CEP19	Q96LK0	163 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	FEV	Q99581	238 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	PKIB	Q9C010	78 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	CHST6	Q9GZX3	395 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	REEP1	Q9H902	201 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	PALMD	Q9NP74	551 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	GLS2	Q9UI32	602 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	HHLA2	Q9UM44	414 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	SERPINE3	A8MV23	424 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF254	O75437	659 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	HAND1	O96004	215 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	TTR	P02766	147 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	CALCB	P10092	127 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	LYL1	P12980	280 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	CDK2	P24941	298 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	PRDX6	P30041	224 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	SLC35B1	P78383	322 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	APOF	Q13790	326 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	HES1	Q14469	280 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	TMEM42	Q69YG0	159 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	COMMD1	Q8N668	190 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702		Q8NFD4	153 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	OR2T29	Q8NH02	315 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	GIPC3	Q8TF64	312 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	SLAMF9	Q96A28	289 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	RAX2	Q96IS3	184 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	APOL4	Q9BPW4	351 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CEP41-215	ENST00000495702	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		5.36	□□□□□ -1.55

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