RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	OR2H2	O95918	312 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	CD28	P10747	220 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC34A1	Q06495	639 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF146	Q15072	292 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618		Q6ZS46	218 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	CFHR4	Q92496	578 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5M11	Q96RB7	305 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	ALG8	Q9BVK2	526 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	AMBN	Q9NP70	447 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	NOTCH1	P46531	2555 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618		G3V4G9	280 aa		11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	F2RL2	O00254	374 aa		11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SH2D1B	O14796	132 aa		11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	GDNF	P39905	211 aa		11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	CCR9	P51686	369 aa		11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	P2RX3	P56373	397 aa		11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	AES	Q08117	197 aa		11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	C11orf88	Q6PI97	169 aa		11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SPSB1	Q96BD6	273 aa		11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	11.79	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618		E9PI62	339 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	FBXO24	O75426	580 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	KDM4B	O94953	1096 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	HCK	P08631	526 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF44	P15621	663 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	GABRB1	P18505	474 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	CD24	P25063	80 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	GLIPR1	P48060	266 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	BLCAP	P62952	87 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	GALE	Q14376	348 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	LPCAT4	Q643R3	524 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC29A1	Q99808	456 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
ATG4B-223	ENST00000493618	SNTN	A6NMZ2	147 aa		11.77	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM225B	P0DP42	221 aa		11.77	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	CDK2	P24941	298 aa		11.77	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	IL18R1	Q13478	541 aa		11.77	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		11.77	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		11.77	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		11.77	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618		Q8N2B8	174 aa		11.77	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		11.77	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		11.77	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		11.77	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		11.77	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		11.77	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		11.77	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A0G2JK05	382 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	HSPB6	O14558	160 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	PEX14	O75381	377 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ZFPL1	O95159	310 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	MT-ND2	P03891	347 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OPN1MW	P04001	364 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	HTR1D	P28221	377 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	FBLN7	Q53RD9	439 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	UTF1	Q5T230	341 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618		Q6P435	159 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	COQ2	Q96H96	371 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF649	Q9BS31	505 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		11.76	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	DEGS1	O15121	323 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ATG4B-223	ENST00000493618	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53

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