RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF20P17024 532 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 CDK2P24941 298 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 SOX2P48431 317 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 RBP2P50120 134 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ACTR3P61158 418 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 CDK5R1Q15078 307 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 Q6P435 159 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 FAM220AQ7Z4H9 259 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OR13C3Q8NGS6 347 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 APH1BQ8WW43 257 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OPALINQ96PE5 141 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 NEK6Q9HC98 313 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 HMG20AQ9NP66 347 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 IMPAD1Q9NX62 359 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 A0A0G2JK05 382 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 VGLL3A8MV65 326 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 F2RL2O00254 374 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 FBXO24O75426 580 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ZFPL1O95159 310 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OPN1MWP04001 364 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 AMY1AP04745 511 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 AMY2AP04746 511 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 LPLP06858 475 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 HTR1AP08908 422 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OPN1MW2P0DN77 364 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OPN1MW3P0DN78 364 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 DBTP11182 482 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF44P15621 663 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 IGLL1P15814 213 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 PEX2P28328 305 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ATP1B3P54709 279 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 P2RX3P56373 397 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ZP1P60852 638 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 PIGYQ3MUY2 71 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 R3HDM4Q96D70 268 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 MALSU1Q96EH3 234 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 HRASLS5Q96KN8 279 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ALG8Q9BVK2 526 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 CLEC7AQ9BXN2 247 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 NOTCH1P46531 2555 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1W2PP11 408 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1W2PPH5 198 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 hADV38S2A0JD32 116 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 GABRPO00591 440 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 CIB2O75838 187 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 KDM4BO94953 1096 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 LALBAP00709 142 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 HCKP08631 526 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 NFYBP25208 207 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OR3A4PP47883 348 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 CDC42P60953 191 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF146Q15072 292 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OR2G6Q5TZ20 316 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM244Q5VVB8 128 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 Q8N2B8 174 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ABHD12Q8N2K0 398 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OR52I1Q8NGK6 324 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 RFESDQ8TAC1 157 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 PP6455Q8WZ26 134 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC3-211ENST00000491581 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.1□□□□□ -1.27
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