RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, human

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKDCC-208	ENST00000490302	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	CLN6	Q9NWW5	311 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302		U3KQK5	164 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	FUOM	A2VDF0	154 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	NUDT19	A8MXV4	375 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	SIRPB1	O00241	398 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	ENTPD6	O75354	484 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	CALCB	P10092	127 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	PRKACA	P17612	351 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	BCL3	P20749	454 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	CD34	P28906	385 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	MYCNOS	P40205	109 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF146	Q15072	292 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	CORO2A	Q92828	525 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	OOSP1	A8MZH6	123 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	KRT8	P05787	483 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM106CP	P0CH98	169 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	LMO1	P25800	156 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	GDNF	P39905	211 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	POU3F4	P49335	361 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	RBP2	P50120	134 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	ATP1B3	P54709	279 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	PRRX1	P54821	245 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	CDC42	P60953	191 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	ZFP57	Q9NU63	452 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PKDCC-208	ENST00000490302	AQP12B	A6NM10	295 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302		H0YHG0	523 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	LY6L	H3BQJ8	138 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	SH2D1B	O14796	132 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	SLC6A1	P30531	599 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	OR3A4P	P47883	348 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	GYS2	P54840	703 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	TFAP2C	Q92754	450 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302		M0R129	80 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	RAMP3	O60896	148 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	OR2H2	O95918	312 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	PTGFR	P43088	359 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	GLIPR1	P48060	266 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	GNGT1	P63211	74 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	AES	Q08117	197 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	SSX6	Q7RTT6	188 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	C10orf35	Q96D05	121 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	P2RX4	Q99571	388 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	TBX5	Q99593	518 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	HMG20A	Q9NP66	347 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	MTCP1	P56278	107 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	TMEM163	Q8TC26	289 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	PP6455	Q8WZ26	134 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302		A0A087X0M5	115 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302		A0A1B0GX30	115 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	ODAM	A1E959	279 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	METTL15	A6NJ78	407 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	SERPINE3	A8MV23	424 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	CALB2	P22676	271 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PKDCC-208	ENST00000490302	SLC35B1	P78383	322 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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