RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	HRH1	P35367	487 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TIMP3	P35625	211 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TAS2R31	P59538	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FGF12	P61328	243 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CXADR	P78310	365 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PRDX4	Q13162	271 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GRK1	Q15835	563 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MICB	Q29980	383 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247		Q5BKY6	102 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	BEST4	Q8NFU0	473 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	S100A13	Q99584	98 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PKIB	Q9C010	78 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CEP250	Q9BV73	2442 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR2AT4	A6NND4	320 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247		K7ENP7	123 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247		M0QYG6	137 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	KLK10	O43240	276 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SSNA1	O43805	119 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CD8A	P01732	235 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SFTPB	P07988	381 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	OR4E1	P0C645	316 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF35	P13682	527 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	PPP3CB	P16298	524 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SELE	P16581	610 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPINA2	P20848	420 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	KITLG	P21583	273 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CALCR	P30988	508 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TDGF1P3	P51864	188 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	GNG3	P63215	75 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	NHLH1	Q02575	133 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	IL24	Q13007	206 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	DHRS2	Q13268	280 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	RSU1	Q15404	277 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	LYG2	Q86SG7	212 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM17	Q86X19	198 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF573	Q86YE8	665 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	CALHM1	Q8IU99	346 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF611	Q8N823	705 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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