RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 SLC19A3Q9BZV2 496 aa3.31□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 FAM206AQ9NX38 181 aa3.31□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 SNX10Q9Y5X0 201 aa3.31□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 MEGF6O75095 1541 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 FANCAO15360 1455 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 MAP3K5Q99683 1374 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 ZNF233A6NK53 670 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 F5H5K5 113 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 F5H768 121 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 M0R1X1 148 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 STX10O60499 249 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 REM1O75628 298 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 DHRS3O75911 302 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 SOX14O95416 240 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 IFNA5P01569 189 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 IFNA14P01570 189 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 IGKV1D-16P01601 117 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 AKR1C4P17516 323 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 ACOT2P49753 483 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 RAP1GDS1P52306 607 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 SLC18A1P54219 525 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 REEP5Q00765 189 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 PNOCQ13519 176 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 SHHQ15465 462 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 MPPED2Q15777 294 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 TBC1D28Q2M2D7 210 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 LYPD2Q6UXB3 125 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 ENTHD1Q8IYW4 607 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 ZNF786Q8N393 782 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 OR4M2Q8NGB6 313 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 PIGXQ8TBF5 258 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 LZICQ8WZA0 190 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 RDH5Q92781 318 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 GHSRQ92847 366 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 RAD51AP1Q96B01 352 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 SMIM19Q96E16 107 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 SMIM12Q96EX1 92 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 BMFQ96LC9 184 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 TMEM208Q9BTX3 173 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 TPK1Q9H3S4 243 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 MFSD1Q9H3U5 465 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 MTCH2Q9Y6C9 303 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 ABCA9Q8IUA7 1624 aa3.3□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 EP400Q96L91 3159 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CD109Q6YHK3 1445 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 A6NDX4 124 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 ARGFXA6NJG6 315 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 OR2AT4A6NND4 320 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 BIRC5O15392 142 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CD5LO43866 347 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 IGLV2-23P01705 113 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CALB1P05937 261 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 RPS17P08708 135 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 S100A1P23297 94 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 TSPOP30536 169 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 TGM4P49221 684 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CLDN12P56749 244 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 RAB4BP61018 213 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 RAP1AP62834 184 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CDC20Q12834 499 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CLEC12BQ2HXU8 276 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CEACAM16Q2WEN9 425 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CCDC153Q494R4 210 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CALHM1Q8IU99 346 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 MKXQ8IYA7 352 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 Q8N9W7 124 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 STOML3Q8TAV4 291 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 SYNPRQ8TBG9 265 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 OR10C1Q96KK4 312 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CCDC42Q96M95 316 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 DHRS9Q9BPW9 319 aa3.29□□□□□ -1.88
CCL20-204ENST00000489160 UGT2B28Q9BY64 529 aa3.29□□□□□ -1.88
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