RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-204	ENST00000481204	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	TECTB	Q96PL2	329 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	DIRC2	Q96SL1	478 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	OR51J1	Q9H342	316 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	OR51I2	Q9H344	312 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	GHITM	Q9H3K2	345 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	PRORY	Q9H606	182 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	OPA3	Q9H6K4	179 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	MSL2	Q9HCI7	577 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	ETAA1	Q9NY74	926 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	AK3	Q9UIJ7	227 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	LAMA5	O15230	3695 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	CACNA1A	O00555	2505 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	C7orf66	A4D0T2	115 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	OR5B21	A6NL26	309 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	OR2AT4	A6NND4	320 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	HSPB6	O14558	160 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	DHFR	P00374	187 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	PRKACA	P17612	351 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	CXCL3	P19876	107 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	HRH1	P35367	487 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	GNG3	P63215	75 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	RBPJ	Q06330	500 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	OR8G1	Q15617	311 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	ZNF124	Q15973	351 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	HOGA1	Q86XE5	327 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	MKX	Q8IYA7	352 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204		Q8N1Y9	231 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	OR4K15	Q8NH41	348 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	MUCL1	Q96DR8	90 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	MICU1	Q9BPX6	476 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	SYT3	Q9BQG1	590 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	GINS4	Q9BRT9	223 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	MED28	Q9H204	178 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	PIGM	Q9H3S5	423 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	IL36G	Q9NZH8	169 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	JKAMP	Q9P055	326 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	COPZ2	Q9P299	210 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	ZNF221	Q9UK13	617 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	DPRX	A6NFQ7	191 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	DISC1	C4P0D8	188 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	C16orf97	H3BN30	126 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204		J3QT63	122 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	CCL21	O00585	134 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	CDIPT	O14735	213 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	WNT9B	O14905	357 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	AKR7A2	O43488	359 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	GCH1	P30793	250 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SKAP2-204	ENST00000481204	NPY4R	P50391	375 aa		5.18	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms