RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANAPC16Q96DE5 110 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEURL1O76050 574 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGHV3-43DP0DP04 118 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR1L4Q8NGR5 311 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUP205Q92621 2012 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MANBALQ9NQG1 85 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCN1AP35498 2009 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR3P46089 330 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC25A42Q86VD7 318 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GNRHR2Q96P88 292 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MIOXQ9UGB7 285 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 M0R2Z0 102 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR4F17Q8NGA8 305 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR8B12Q8NGG6 310 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR2A5Q96R48 311 aa15.2■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAMPP49913 170 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LYG1Q8N1E2 194 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRGPRX3Q96LB0 322 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CRISP2P16562 243 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM209AQ5JX71 171 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SOCS1O15524 211 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LANCL1O43813 399 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LYPD8Q6UX82 237 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAB33BQ9H082 229 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRSS50Q9UI38 385 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HLA-GP17693 338 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C19orf57Q0VDD7 668 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MESTQ5EB52 335 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CBLN3Q6UW01 205 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ASB10Q8WXI3 467 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DOK5Q9P104 306 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FZR1Q9UM11 496 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1W2PR80 420 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NDUFB3O43676 98 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 Q56UQ5 140 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRC10Q5BKY1 277 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEU3Q9UQ49 428 aa15.19■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRP11Q86VZ4 500 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR10AC1Q8NH08 325 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FNDC7Q5VTL7 733 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR5M9Q8NGP3 310 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STARD10Q9Y365 291 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LMO7DNF2Z398 122 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CIDEAO60543 219 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FZD5Q13467 585 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM92Q6UXU6 159 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD37Q7Z713 158 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR1L3Q8NH93 324 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANXA10Q9UJ72 324 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZIC1Q15915 447 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MPV17LQ2QL34 196 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HLA-BQ31612 363 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DHRS11Q6UWP2 260 aa15.18■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNFSF15O95150 251 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SP1P08047 785 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIR2DS2P43631 304 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR10A7Q8NGE5 316 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SH2D2AQ9NP31 389 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR1A1Q9P1Q5 309 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 B4DEV8 164 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCL2P13500 99 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPEPL1Q8NDH3 523 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WDR13Q9H1Z4 485 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHST1O43916 411 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR1C1Q15619 314 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HLA-DRB5Q30154 266 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DEFB109BQ30KR1 87 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CA10Q9NS85 328 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C11orf94C9JXX5 98 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LHFPL5Q8TAF8 219 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FLRT3Q9NZU0 649 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COL9A1P20849 921 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IFITM3Q01628 133 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR1L6Q8NGR2 347 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALG14Q96F25 216 aa15.17■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa15.16■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SNCGO76070 127 aa15.16■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRSS12P56730 875 aa15.16■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VN1R4Q7Z5H5 301 aa15.16■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DYRK2Q92630 601 aa15.16■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR10C1Q96KK4 312 aa15.16■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DOCK5Q9H7D0 1870 aa15.16■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LINC01387J3KSC0 135 aa15.16■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC25A30Q5SVS4 291 aa15.16■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRAT1Q6PIZ9 186 aa15.16■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FUT9Q9Y231 359 aa15.16■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MFNGO00587 321 aa15.16■□□□□ 0.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ELOBQ15370 118 aa15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms