RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 C12orf73Q69YU5 71 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 Q6ZR03 302 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 MOB3CQ70IA8 216 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 PTOV1Q86YD1 416 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 LRRC18Q8N456 261 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 OR6X1Q8NH79 312 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 PFN4Q8NHR9 129 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 HIST1H2ACQ93077 130 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 ARHGDIGQ99819 225 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 TUBA4BQ9H853 241 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 NIT2Q9NQR4 276 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 DECR2Q9NUI1 292 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 RASL12Q9NYN1 266 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 BTBD17A6NE02 478 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 FAM74A7A6NL05 159 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 DISC1C4P0D8 188 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 SLC31A2O15432 143 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 GADD45GO95257 159 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 SELLP14151 372 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 TNFRSF1BP20333 461 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 CPT2P23786 658 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 BTCP35070 178 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 RAB5CP51148 216 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 ERVK-25P63136 954 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF345Q14585 488 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 HMGN3Q15651 99 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 HIST3H3Q16695 136 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 C22orf42Q6IC83 251 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 REEP3Q6NUK4 255 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 TMUB2Q71RG4 321 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 ABHD4Q8TB40 342 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 ASB10Q8WXI3 467 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 MCHR2Q969V1 340 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 MCHR1Q99705 422 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 GINS4Q9BRT9 223 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.5□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 C5orf49A4QMS7 147 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 G3V3Q6 166 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 RNF13O43567 381 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF205O95201 554 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 MT-ATP6P00846 226 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 MT-ND5P03915 603 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 GLAP06280 429 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 SBK2P0C263 348 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 CXCL3P19876 107 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 CD80P33681 288 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 SLC6A9P48067 706 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 MMP16P51512 607 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 CAPZA1P52907 286 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 CLRN1P58418 232 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 RAB2AP61019 212 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 PSG4Q00888 419 aa6.49□□□□□ -1.37
SZRD1-208ENST00000476423 PAX2Q02962 417 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms