RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 PRTN3P24158 256 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 IFNGR2P38484 337 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB25P57735 213 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTBP60709 375 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 C1QTNF8P60827 252 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTG1P63261 375 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 MPPED2Q15777 294 aa4.05□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 SAXO2Q658L1 398 aa4.05□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 C10orf67Q8IYJ2 551 aa4.05□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC112Q8NEF3 446 aa4.05□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.05□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa4.04□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 M0R036 132 aa4.04□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 EPPINO95925 133 aa4.04□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 OR56A5P0C7T3 313 aa4.04□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 CD99P14209 185 aa4.04□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF235Q14590 738 aa4.04□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 OR8K1Q8NGG5 319 aa4.04□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP4.04□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV3-15P01624 115 aa4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF823P16415 610 aa4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 TTLQ8NG68 377 aa4.03□□□□□ -1.76
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RABGGTB-209ENST00000473406 ABCC11Q96J66 1382 aa4.02□□□□□ -1.77
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RABGGTB-209ENST00000473406 C8orf87E5RJ46 101 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 COX7A2P2O60397 106 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 RBBP9O75884 186 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 VAMP5O95183 116 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 LYPLA2O95372 231 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 ISG15P05161 165 aa4.02□□□□□ -1.77
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF19P17023 458 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 ME2P23368 584 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 CBX5P45973 191 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 SMAGPQ0VAQ4 97 aa4.02□□□□□ -1.77
RABGGTB-209ENST00000473406 SSX1Q16384 188 aa4.02□□□□□ -1.77
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