RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	LALBA	P00709	142 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF728	P0DKX0	622 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	BMX	P51813	675 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	AQP4	P55087	323 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ACSM1	Q08AH1	577 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	RSU1	Q15404	277 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	PLA1A	Q53H76	456 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	DDI2	Q5TDH0	399 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM86B	Q8N661	226 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	GHSR	Q92847	366 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	TNFRSF14	Q92956	283 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF714	Q96N38	554 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	PPA2	Q9H2U2	334 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	CKLF	Q9UBR5	152 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ING4	Q9UNL4	249 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PPK0	400 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	GABRP	O00591	440 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	MGST3	O14880	152 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	DEGS1	O15121	323 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	GPR137B	O60478	399 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	PSPN	O60542	156 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	KDM4B	O94953	1096 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	HTR3B	O95264	441 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ARG1	P05089	322 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	PAX6	P26367	422 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	IER3	P46695	156 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	RAG2	P55895	527 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	TFAP2C	Q92754	450 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	VCX3B	Q9H321	246 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	SCN3B	Q9NY72	215 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SSR4-208	ENST00000471880	FUOM	A2VDF0	154 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	OGG1	O15527	345 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	CEL	P19835	753 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	BDKRB2	P30411	391 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	OR3A1	P47881	315 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	OR3A4P	P47883	348 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	WNT4	P56705	351 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R43	P59537	309 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	AES	Q08117	197 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	RIPK1	Q13546	671 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF146	Q15072	292 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	LY6E	Q16553	131 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	C17orf50	Q8WW18	174 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	NRG4	Q8WWG1	115 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	DYRK2	Q92630	601 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880		H0YJX3	145 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880		H3BUX3	64 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	CDRT1	O95170	752 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	MTNR1B	P49286	362 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	P2RX3	P56373	397 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	ZP1	P60852	638 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	TAF9	Q16594	264 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880		Q499Y3	187 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	MIDN	Q504T8	468 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	HCP5	Q6MZN7	132 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	OR4F5	Q8NH21	305 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	MYDGF	Q969H8	173 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	OR14A2	Q96R54	314 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	SSX3	Q99909	188 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	BEX1	Q9HBH7	125 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	FAM172BP	A6NC97	362 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	C17orf98	A8MV24	154 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	ALX3	O95076	343 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINA2	P20848	420 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SSR4-208	ENST00000471880	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		12.06	□□□□□ -0.48

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