RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457356.8

MSC-AS1-201, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MSC-AS1, Length 4,220 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-201ENST00000457356 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.65□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.65□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.65□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.65□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
MSC-AS1-201ENST00000457356 ADAM11O75078 769 aa8.65□□□□□ -1.03
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MSC-AS1-201ENST00000457356 CTLA4P16410 223 aa8.65□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
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MSC-AS1-201ENST00000457356 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
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MSC-AS1-201ENST00000457356 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 MOB1AQ9H8S9 216 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 NEU3Q9UQ49 428 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.64□□□□□ -1.03
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MSC-AS1-201ENST00000457356 TMEM127O75204 238 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 SLC25A22Q9H936 323 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 ARID2Q68CP9 1835 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 A0A1W2PR77 199 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 FCN1O00602 326 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 DHHO43323 396 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 EFNB2P52799 333 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 RANP62826 216 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 FAM78BQ5VT40 261 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 CT55Q8WUE5 264 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.64□□□□□ -1.03
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MSC-AS1-201ENST00000457356 C5orf49A4QMS7 147 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 HSPB2A8KAH6 182 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 CXCL13O43927 109 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 TOX4O94842 621 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 B4GALT1P15291 398 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 GZMMP51124 257 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 HSPB2Q16082 182 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 BSXQ3C1V8 233 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 GFRALQ6UXV0 394 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 FAM60AQ9NP50 221 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 TMED3Q9Y3Q3 217 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 LCTP09848 1927 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 NCOR2Q9Y618 2525 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 TECTAO75443 2155 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 SOCS1O15524 211 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 OGG1O15527 345 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 CTSVO60911 334 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 CT45A6P0DMU7 189 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 CT45A5P0DMU8 189 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 CT45A7P0DMV0 189 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 CT45A8P0DMV1 189 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 CT45A9P0DMV2 189 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 FUT3P21217 361 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 CD82P27701 267 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 DLK1P80370 383 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRDX4Q13162 271 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 RAB35Q15286 201 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 CT45A1Q5HYN5 189 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 MRGPREQ86SM8 312 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 CARFQ8N187 725 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 CT45A3Q8NHU0 189 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 EXTL1Q92935 676 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 PCNX2A6NKB5 2137 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 SEMA7AO75326 666 aa8.63□□□□□ -1.03
MSC-AS1-201ENST00000457356 C1QL1O75973 258 aa8.63□□□□□ -1.03
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