RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C1orf198Q9H425 327 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USE1Q9NZ43 259 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STARD10Q9Y365 291 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDK2AP2O75956 126 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLIC3O95833 236 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTHP01270 115 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MT-ND2P03891 347 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OPN1MWP04001 364 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LYNX1P0DP58 116 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR5AS1Q8N127 324 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF525Q8N782 197 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 THEM6Q8WUY1 208 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 S1PR3Q99500 378 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBX5Q99593 518 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATF6BQ99941 703 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COPS4Q9BT78 406 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COPS3Q9UNS2 423 aa6.97□□□□□ -1.29
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.96□□□□□ -1.3
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 DLGAP1O14490 977 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ENTPD6O75354 484 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACSM4P0C7M7 580 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CALCBP10092 127 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.96□□□□□ -1.3
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF383Q8NA42 475 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CMBLQ96DG6 245 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TEAD3Q99594 435 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMR3AQ99954 134 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TREM2Q9NZC2 230 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZFHX3Q15911 3703 aa6.96□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 E9PQ18 207 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H7C417 338 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 M0R135 149 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 M0R233 179 aa6.95□□□□□ -1.3
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COX5BP10606 129 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF250P15622 560 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CX3CR1P49238 355 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDLIM4P50479 330 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSG7Q13046 419 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCK2Q16822 640 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SSX6Q7RTT6 188 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF283Q8N7M2 679 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OTOSQ8NHW6 89 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYGBQ8WWM9 190 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF799Q96GE5 643 aa6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.95□□□□□ -1.3
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