RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 CATR1Q13166 79 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CEACAM16Q2WEN9 425 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 Q499Y3 187 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 NOXRED1Q6NXP6 359 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 KIR2DL5AQ8N109 375 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00116Q8NCU8 138 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR51E1Q8TCB6 317 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 FAM3DQ96BQ1 224 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 VSTM2LQ96N03 204 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 MCHR1Q99705 422 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 GPR27Q9NS67 375 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 SIGLEC7Q9Y286 467 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 LOC730098B7Z3J9 87 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 J3KTA2 159 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 P2RY10O00398 339 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CSN1S1P47710 185 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 FUT5Q11128 374 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 RAB40CQ96S21 281 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TTC37Q6PGP7 1564 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 CCL22O00626 93 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 KLRB1Q12918 225 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 COMMD6Q7Z4G1 85 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 HES7Q9BYE0 225 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PLPP2O43688 288 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 IL4P05112 153 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00869P0C866 280 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 OR5D13Q8NGL4 314 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 RNF183Q96D59 192 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 DERL3Q96Q80 235 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 NPY6RQ99463 290 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 DUSP23Q9BVJ7 150 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 OR2H1Q9GZK4 316 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 RND3P61587 244 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 OR4A5Q8NH83 315 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 HAPLN2Q9GZV7 340 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 CST3P01034 146 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 VSIG10L2P0DP72 767 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 FAHP16930 419 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 RGRP47804 291 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-209ENST00000442510 CLECL1Q8IZS7 167 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 RTP4Q96DX8 246 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PGLYRP3Q96LB9 341 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 PLPP3O14495 311 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 LEPROTL1O95214 131 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-209ENST00000442510 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
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