RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 RABEPKQ7Z6M1 372 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF429Q86V71 674 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 OR10G3Q8NGC4 313 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 OR13D1Q8NGV5 346 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 RNF138Q8WVD3 245 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 TVP23CQ96ET8 276 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 TGIF2Q9GZN2 237 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 METTL9Q9H1A3 318 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 METTL7AQ9H8H3 244 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 WNT16Q9UBV4 365 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa12.97□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 K7ESF4 209 aa12.96□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 OR2J2O76002 312 aa12.96□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 TAF9Q16594 264 aa12.96□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 C14orf144Q96I85 54 aa12.96□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 LIPGQ9Y5X9 500 aa12.96□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 RFNGQ9Y644 331 aa12.96□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa12.96□□□□□ -0.33
TOP3B-206ENST00000436282 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa12.96□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 FAM24AA6NFZ4 105 aa12.96□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 PPP1R2P9O14990 202 aa12.96□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CEBPGP53567 150 aa12.96□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 UCP3P55916 312 aa12.96□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 HIST3H2BBQ8N257 126 aa12.96□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SLC35G3Q8N808 338 aa12.96□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa12.96□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC54Q8NEL0 328 aa12.96□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GJC3Q8NFK1 279 aa12.96□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 HLA-CQ95604 372 aa12.96□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF700Q9H0M5 742 aa12.96□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa12.96□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa12.96□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 IGSF23A1L1A6 192 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 MSR1P21757 451 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 RBP2P50120 134 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 MTCP1P56278 107 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 ICAM4Q14773 271 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 RSU1Q15404 277 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 OR11L1Q8NGX0 322 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 MOB3AQ96BX8 217 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 HSPA12AO43301 675 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CDS2O95674 445 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GLIPR1P48060 266 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CD81P60033 236 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CHAF1BQ13112 559 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF506Q5JVG8 444 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SLC22A25Q6T423 547 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GPR173Q9NS66 373 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF581Q9P0T4 197 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 OR5H15A6NDH6 313 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF724A8MTY0 619 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CYB5BO43169 146 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 ANGPTL7O43827 346 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SOD3P08294 240 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 DBHP09172 617 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 RGS19P49795 217 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SLC35E3Q7Z769 313 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 S100PBPQ96BU1 408 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 RHOVQ96L33 236 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC74BQ96LY2 380 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 GPR61Q9BZJ8 451 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 WSB1Q9Y6I7 421 aa12.95□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 RTTNQ86VV8 2226 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 NR2C1P13056 603 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 KHDC3LQ587J8 217 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 LYSMD4Q5XG99 296 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SPSB1Q96BD6 273 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SGK3Q96BR1 496 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 AQP7P3A6NL99 342 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 TRGC2P03986 189 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 PRAMEF20Q5VT98 475 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 OR5L2Q8NGL0 311 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM171Q8WVE6 324 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 TP53RKQ96S44 253 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A31Q9H0C2 315 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF286AQ9HBT8 521 aa12.94□□□□□ -0.34
TOP3B-206ENST00000436282 MYOTQ9UBF9 498 aa12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms