RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 H3BUI4 141 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 KDM4BO94953 1096 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 CSN2P05814 226 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 HTR1DP28221 377 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP1P28562 367 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 OR52W1Q6IF63 320 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 REC114Q7Z4M0 266 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 RTN4RL2Q86UN3 420 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 SAXO1Q8IYX7 474 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 NDNFQ8TB73 568 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 CORO2AQ92828 525 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
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LIMS1-208ENST00000428064 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 HILPDAQ9Y5L2 63 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 ORC6Q9Y5N6 252 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 SNTNA6NMZ2 147 aa16.85■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 SH2D1BO14796 132 aa16.85■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 XPNPEP2O43895 674 aa16.85■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 OR2H2O95918 312 aa16.85■□□□□ 0.29
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LIMS1-208ENST00000428064 CD28P10747 220 aa16.85■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 SLC34A1Q06495 639 aa16.85■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 HEPN1Q6WQI6 88 aa16.85■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa16.85■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 ACBD7Q8N6N7 88 aa16.85■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 OR4F17Q8NGA8 305 aa16.85■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 OR4F4Q96R69 305 aa16.85■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 OR4C45A6NMZ5 311 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 MMP23AO75900 390 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 ALX3O95076 343 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1D-12P01611 117 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 CD34P28906 385 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 BDH1Q02338 343 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 CHST4Q8NCG5 386 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 OR51A4Q8NGJ6 313 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 OR13C3Q8NGS6 347 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF596Q8TC21 504 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 PYDC1Q8WXC3 89 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 PELI1Q96FA3 418 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 NEK6Q9HC98 313 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa16.84■□□□□ 0.29
LIMS1-208ENST00000428064 SIRPB1O00241 398 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 EI24O14681 340 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 PEX14O75381 377 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV1-47P01700 117 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 OCM2P0CE71 109 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ALDH3A2P51648 485 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 BLCAPP62952 87 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 OR10AC1Q8NH08 325 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 DNAH3Q8TD57 4116 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 AKR1E2Q96JD6 320 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 C4orf36Q96KX1 117 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 OCSTAMPQ9BR26 566 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 MMP28Q9H239 520 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 LIN7BQ9HAP6 207 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 DPM3Q9P2X0 92 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGDIBP52566 201 aa16.82■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 SNU13P55769 128 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 FBLN7Q53RD9 439 aa16.82■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZS46 218 aa16.82■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 SYS1Q8N2H4 156 aa16.82■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD12Q8N2K0 398 aa16.82■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 OR13C9Q8NGT0 318 aa16.82■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 RFT1Q96AA3 541 aa16.82■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 CREB3L1Q96BA8 519 aa16.82■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa16.82■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087X0M5 115 aa16.81■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1B0GX30 115 aa16.81■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 J3QLW9 94 aa16.81■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 CALCBP10092 127 aa16.81■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF19P17023 458 aa16.81■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 GABRB1P18505 474 aa16.81■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 CDK2P24941 298 aa16.81■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 BRS3P32247 399 aa16.81■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 GALEQ14376 348 aa16.81■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa16.81■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ZFP1Q6P2D0 407 aa16.81■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 LYG1Q8N1E2 194 aa16.81■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 LGALS12Q96DT0 336 aa16.81■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 ODAMA1E959 279 aa16.8■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 LEUTXA8MZ59 168 aa16.8■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 H3BNX3 289 aa16.8■□□□□ 0.28
LIMS1-208ENST00000428064 PTGFRP43088 359 aa16.8■□□□□ 0.28
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