RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC22A25Q6T423 547 aa3.4□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 LHFPL1Q86WI0 220 aa3.4□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF573Q86YE8 665 aa3.4□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 C17orf78Q8N4C9 275 aa3.4□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 MITD1Q8WV92 249 aa3.4□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 TOMM40LQ969M1 308 aa3.4□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR137Q96N19 417 aa3.4□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 EDARQ9UNE0 448 aa3.4□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 OSGIN2Q9Y236 505 aa3.4□□□□□ -1.86
LRRTM4-201ENST00000409088 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 C5orf51A6NDU8 294 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5B21A6NL26 309 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 MCRIP1C9JLW8 97 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 RHBDL1O75783 438 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 CRYABP02511 175 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP3CBP16298 524 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 CXCL2P19875 107 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 COX5AP20674 150 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 DTYMKP23919 212 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 FPR2P25090 351 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 CALCRP30988 508 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 TAS2R31P59538 309 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 FGF12P61328 243 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 PSG7Q13046 419 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 MPPED2Q15777 294 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXW12Q6X9E4 464 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 C5orf24Q7Z6I8 188 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM200AQ86VY9 491 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 SPACA3Q8IXA5 215 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5M8Q8NGP6 311 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 EXTL1Q92935 676 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM230Q96A57 120 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 FAHD2AQ96GK7 314 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 FZR1Q9UM11 496 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa3.4□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 M0R233 179 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 HS3ST1O14792 307 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 CGAP01215 116 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV3-15P01624 115 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 GRPP07492 148 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 CECR9P0C854 216 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 SELEP16581 610 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 PTGER4P35408 488 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 MPV17P39210 176 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 FABP6P51161 128 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 FXYD4P59646 89 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 OPCMLQ14982 345 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 ELP2Q6IA86 826 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM180AQ6UWF9 173 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 TEX261Q6UWH6 196 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 CLEC18BQ6UXF7 455 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 BEND4Q6ZU67 534 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF767PQ75MW2 155 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 WFDC8Q8IUA0 241 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 SAXO1Q8IYX7 474 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF680Q8NEM1 530 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM185AQ8NFB2 350 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 Q8NFD4 153 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 RDH5Q92781 318 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR13Q9H1Z4 485 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 LIME1Q9H400 295 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF286AQ9HBT8 521 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 OBP2BQ9NPH6 170 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 COMMD9Q9P000 198 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM215AQ9Y5M1 114 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 U3KQ87 197 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 ATMQ13315 3056 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 ARID1AO14497 2285 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 CEACAM18A8MTB9 384 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 H0YL77 283 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 J3QW42 95 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 CDIPTO14735 213 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 RRP8O43159 456 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 RGS11O94810 467 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 SFT2D2O95562 160 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 MPC2O95563 127 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM4-201ENST00000409088 RAC2P15153 192 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms