RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.26□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.26□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 NSG2Q9Y328 171 aa7.26□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SHISA7A6NL88 538 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SERPINE2P07093 398 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 GRPP07492 148 aa7.25□□□□□ -1.25
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SNX13-201ENST00000409076 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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SNX13-201ENST00000409076 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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SNX13-201ENST00000409076 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SPINK14Q6IE38 97 aa7.25□□□□□ -1.25
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SNX13-201ENST00000409076 TP53RKQ96S44 253 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.25□□□□□ -1.25
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SNX13-201ENST00000409076 PLCE1Q9P212 2302 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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SNX13-201ENST00000409076 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SPINK4O60575 86 aa7.25□□□□□ -1.25
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SNX13-201ENST00000409076 PGA3P0DJD8 388 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SLC25A4P12235 298 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 CARD18P57730 90 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.25□□□□□ -1.25
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SNX13-201ENST00000409076 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.25□□□□□ -1.25
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SNX13-201ENST00000409076 P04436 131 aa7.25□□□□□ -1.25
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SNX13-201ENST00000409076 GAPTQ8N292 157 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 NTNG2Q96CW9 530 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 OXGR1Q96P68 337 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 RAB18Q9NP72 206 aa7.25□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.25□□□□□ -1.25
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SNX13-201ENST00000409076 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 CST4P01036 141 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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SNX13-201ENST00000409076 ERVS71-1P61550 626 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SLC35A1P78382 337 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ZNF92Q03936 586 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 CALHM1Q8IU99 346 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ZNF383Q8NA42 475 aa7.24□□□□□ -1.25
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SNX13-201ENST00000409076 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ATMQ13315 3056 aa7.24□□□□□ -1.25
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SNX13-201ENST00000409076 F8VVB4 439 aa7.24□□□□□ -1.25
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SNX13-201ENST00000409076 MSTNO14793 375 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 CLN5O75503 358 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 DHRS3O75911 302 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 JTBO76095 146 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SLC34A2O95436 690 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 TRGC2P03986 189 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 RFPL3SP0C7P2 107 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 RNF224P0DH78 156 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 RAB5AP20339 215 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 G0S2P27469 103 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 OR2T2Q6IF00 324 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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