RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405655.7

PRAME-205, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-205ENST00000405655 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa11.96□□□□□ -0.49
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PRAME-205ENST00000405655 OR5H8P0DN80 308 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-205ENST00000405655 MPZP25189 248 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-205ENST00000405655 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PRAME-205ENST00000405655 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
PRAME-205ENST00000405655 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa11.96□□□□□ -0.49
PRAME-205ENST00000405655 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
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PRAME-205ENST00000405655 ARRDC1Q8N5I2 433 aa11.95□□□□□ -0.5
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PRAME-205ENST00000405655 OR8G1Q15617 311 aa11.94□□□□□ -0.5
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PRAME-205ENST00000405655 FAM58AQ8N1B3 248 aa11.94□□□□□ -0.5
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PRAME-205ENST00000405655 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
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PRAME-205ENST00000405655 Q8NFD4 153 aa11.94□□□□□ -0.5
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PRAME-205ENST00000405655 ZNF573Q86YE8 665 aa11.93□□□□□ -0.5
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PRAME-205ENST00000405655 OR5M8Q8NGP6 311 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-205ENST00000405655 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-205ENST00000405655 SYT3Q9BQG1 590 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-205ENST00000405655 SLA2Q9H6Q3 261 aa11.93□□□□□ -0.5
PRAME-205ENST00000405655 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRAME-205ENST00000405655 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa11.92□□□□□ -0.5
PRAME-205ENST00000405655 ZNF44P15621 663 aa11.92□□□□□ -0.5
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