RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa11.46□□□□□ -0.57
TMOD1-202ENST00000375175 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 JTBO76095 146 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 F10P00742 488 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 LCATP04180 440 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 RRADP55042 308 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 CASP6P55212 293 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 PKIAP61925 76 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 RAC1P63000 192 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 KHDC3LQ587J8 217 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 FAM27BQ5VT28 67 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF774Q6NX45 483 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF343Q6P1L6 599 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 C20orf196Q8IYI0 205 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF610Q8N9Z0 462 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 REEP6Q96HR9 211 aa11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 CBR3O75828 277 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 PATE4P0C8F1 98 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 OPRM1P35372 400 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 RAB1AP62820 205 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 PPA1Q15181 289 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 M1APQ8TC57 530 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 ERGIC1Q969X5 290 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 C10orf35Q96D05 121 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 MUCL1Q96DR8 90 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 GALNT14Q96FL9 552 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 LURAP1Q96LR2 239 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 Q96M66 194 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 SLC35B3Q9H1N7 401 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF850A8MQ14 1090 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 HIST1H2BKO60814 126 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 HIST1H2BJP06899 126 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 CXCL1P09341 107 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 OR5H8P0DN80 308 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 HIST1H2BOP23527 126 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 HIST1H2BBP33778 126 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 CAMLGP49069 296 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 UCP2P55851 309 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 HIST1H2BDP58876 126 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 HIST1H2BCP62807 126 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 FAM3AP98173 230 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 HIST2H2BEQ16778 126 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 AGBL5Q8NDL9 886 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 HIST1H2BHQ93079 126 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 TOMM40LQ969M1 308 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 HIST1H2BNQ99877 126 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 HIST1H2BMQ99879 126 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 CRLF2Q9HC73 371 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 ANXA10Q9UJ72 324 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 PADI1Q9ULC6 663 aa11.45□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 SEC14L6B5MCN3 397 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 TSTD3H0UI37 97 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 CA11O75493 328 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF205O95201 554 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 IFNA21P01568 189 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 ECI1P42126 302 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 BRICD5Q6PL45 260 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 PLXDC2Q6UX71 529 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 HIST3H2BBQ8N257 126 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 COMMD1Q8N668 190 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 OR14L1PQ8NHC6 308 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 Q8WTZ3 238 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF581Q9P0T4 197 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 AK3Q9UIJ7 227 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 PILRBQ9UKJ0 227 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC187A0A096LP49 1063 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 GJE1A6NN92 205 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 SCGB1D2O95969 90 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 DANCRP0C864 163 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 RAB35Q15286 201 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 SPSB1Q96BD6 273 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 BORCS8Q96FH0 119 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 C19orf12Q9NSK7 152 aa11.44□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF587BE7ETH6 402 aa11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 PPP1R2P9O14990 202 aa11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 FABP4P15090 132 aa11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 B4GALT1P15291 398 aa11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 CHATP28329 748 aa11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TMOD1-202ENST00000375175 CARD18P57730 90 aa11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms