RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa10.25□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 UBE2QL1A1L167 161 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 LGALS8O00214 317 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 MFNGO00587 321 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 HSPB6O14558 160 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 UPK1BO75841 260 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 GLAP06280 429 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 LPLP06858 475 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PTHLHP12272 177 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CHATP28329 748 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PRDX2P32119 198 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 MDH2P40926 338 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CBX5P45973 191 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM50BP56557 158 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 DEFA1P59665 94 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 DEFA3P59666 94 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 AP3S2P59780 193 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CARTPTQ16568 116 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PLAC9Q5JTB6 97 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 HACD4Q5VWC8 232 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SUMF2Q8NBJ7 301 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 DEFB108BQ8NET1 73 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SMIM4Q8WVI0 70 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 FAAP24Q9BTP7 215 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 IFT22Q9H7X7 185 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PALMDQ9NP74 551 aa10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ISPDA4D126 451 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CA11O75493 328 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF205O95201 554 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ECDO95905 644 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 MELTFP08582 738 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PSG2P11465 335 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 IL7P13232 177 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 COL8A2P25067 703 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 EFNA4P52798 201 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 DGCR2P98153 550 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 GUCA2AQ02747 115 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 COL10A1Q03692 680 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 FAM201AQ5SY85 155 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 TEX36Q5VZQ5 186 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SIGIRRQ6IA17 410 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 BRICD5Q6PL45 260 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 TOMM5Q8N4H5 51 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF561Q8N587 486 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 OR52I2Q8NH67 350 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SETD6Q8TBK2 473 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ZFAND2BQ8WV99 257 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 RAB1CQ92928 201 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 MARVELD3Q96A59 401 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SEH1LQ96EE3 360 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF665Q9H7R5 613 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ETAA1Q9NY74 926 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 TAS2R8Q9NYW2 309 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CACNG2Q9Y698 323 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 MEIS3P1A6NDR6 274 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CENPXA8MT69 81 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 H7C1Q1 480 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 NDUFA2O43678 99 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 GYPAP02724 150 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CSF1P09603 554 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CSF3P09919 207 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 RCVRNP35243 200 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 GDNFP39905 211 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 KCNJ3P48549 501 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 BTG1P62324 171 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 BAK1Q16611 211 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF787Q6DD87 383 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 Q6P435 159 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 YIPF5Q969M3 257 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 MED30Q96HR3 178 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SULT4A1Q9BR01 284 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 PPA2Q9H2U2 334 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 CHODLQ9H9P2 273 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PTPRK-201ENST00000368202 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms