RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CD24P25063 80 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 NPY4RP50391 375 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 VMA21Q3ZAQ7 101 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 Q499Y3 187 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM69Q5SWH9 247 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2UQ5VVX9 321 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 GPR107Q5VW38 600 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 DEGS2Q6QHC5 323 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 TMED4Q7Z7H5 227 aa3.77□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 OR56B1Q8NGI3 324 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 OR5H2Q8NGV7 314 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 OR8U1Q8NH10 309 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 RAB3CQ96E17 227 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CDCA4Q9BXL8 241 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 PSG11Q9UQ72 335 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 L7N2F9 121 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 MGST3O14880 152 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 CLEC3BP05452 202 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CSF1P09603 554 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 APELAP0DMC3 54 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 GAAP10253 952 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 RAB3BP20337 219 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 WNT4P56705 351 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 GABARAPL2P60520 117 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 C22orf42Q6IC83 251 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 OR10K2Q6IF99 312 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 APH1BQ8WW43 257 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 SGK3Q96BR1 496 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 POM121L2Q96KW2 1035 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 MS4A10Q96PG2 267 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC7AQ9BXN2 247 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A17O43808 307 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 HTR2CP28335 458 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 TPBGQ13641 420 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 TRAM1Q15629 374 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 FAM27D1Q5T7N8 215 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 KIRREL1Q96J84 757 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 CENPOQ9BU64 300 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 GON7Q9BXV9 100 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 GSX2Q9BZM3 304 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CDK1P06493 297 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC35A2P78381 396 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 SMCO1Q147U7 214 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 KIR2DS1Q14954 304 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 KISS1Q15726 138 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 WDR38Q5JTN6 314 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 C16orf87Q6PH81 154 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS57Q6UWY2 283 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.76□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 TMEM208Q9BTX3 173 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R8Q9NYW2 309 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 IL36GQ9NZH8 169 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 V9GY05 133 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 PCNX3Q9H6A9 2034 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CEBPZOSA8MTT3 80 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 DCTN6O00399 190 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 SULT1C4O75897 302 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 SCGB1D2O95969 90 aa3.75□□□□□ -1.81
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