RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 A0A0B4J2E0 115 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1B0GX12 115 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 H3BNC9 293 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 Q56UQ5 140 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 OR4S2Q8NH73 311 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 ZFPL1O95159 310 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 PPICP45877 212 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 RTP2Q5QGT7 225 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 SLC25A26Q70HW3 274 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM230Q96A57 120 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 NCOR1O75376 2440 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 EFSO43281 561 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 AKR7A3O95154 331 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 FOLR2P14207 255 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 OPRK1P41145 380 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 DYNLT3P51808 116 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 P4HTMQ9NXG6 502 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 LRP12Q9Y561 859 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 LBX1P52954 281 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 HBZP02008 142 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 RELBQ01201 579 aa7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 CDC14BO60729 498 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 OR1D5P58170 312 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF740Q8NDX6 193 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 ZG16BQ96DA0 208 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 SERTM1A2A2V5 107 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 MPDU1O75352 247 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 PRSS23O95084 383 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 TSPAN13O95857 204 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 CAMPP49913 170 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 WBP2Q969T9 261 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 CLDN16Q9Y5I7 305 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 GRPP07492 148 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM215Q68D42 235 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 RDH5Q92781 318 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 GGACTQ9BVM4 153 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 STARD10Q9Y365 291 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 ONECUT2O95948 504 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 CST9Q5W186 159 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 SH2D5Q6ZV89 423 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 MARCH3Q86UD3 253 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 MOB3AQ96BX8 217 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 NTMQ9P121 344 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 M0R296 226 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 CEBPBP17676 345 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 CD38P28907 300 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 RGRP47804 291 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 ISOC2Q96AB3 205 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 A4GNTQ9UNA3 340 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 B9D1Q9UPM9 204 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 SDK2Q58EX2 2172 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 PLXNB2O15031 1838 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 C5orf49A4QMS7 147 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 NUDT3O95989 172 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 NTHL1P78549 312 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 ABCA4P78363 2273 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 FCARP24071 287 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 NUBPLQ8TB37 319 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 PDCD6O75340 191 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 LINC00597Q9H2U6 94 aa7.35□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 RECKO95980 971 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 IER3P46695 156 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 HFEQ30201 348 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.34□□□□□ -1.23
PKHD1-201ENST00000340994 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms