RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 MYL12AP19105 171 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 EMP1P54849 157 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 DEFA1P59665 94 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 DEFA3P59666 94 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 RPL27P61353 136 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 GNG5P63218 68 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 DGCR2P98153 550 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 GGTLC2Q14390 218 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 TMEM64Q6YI46 380 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 SVBPQ8N300 66 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 OR4S1Q8NGB4 309 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 DDIT4LQ96D03 193 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 DYNLL2Q96FJ2 89 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 TRIB3Q96RU7 358 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 OR2J1Q9GZK6 312 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 GPR84Q9NQS5 396 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 COMMD3Q9UBI1 195 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 PRNDQ9UKY0 176 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 CES1P1Q9UKY3 287 aa5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 ZNF814B7Z6K7 855 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 UPK1AO00322 258 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 PDCD5O14737 125 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 SERPINE1P05121 402 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 ADRA2AP08913 450 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 CHATP28329 748 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 OPRD1P41143 372 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 RUNX3Q13761 415 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 CDSNQ15517 529 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 SSX1Q16384 188 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 TMEM52BQ4KMG9 183 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 OR13A1Q8NGR1 328 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 PPCDCQ96CD2 204 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 GPR146Q96CH1 333 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 TEX37Q96LM6 180 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 FRG2BQ96QU4 278 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 FAM173AQ9BQD7 235 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 RNF121Q9H920 327 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 PELI2Q9HAT8 420 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 NAT8Q9UHE5 227 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 HS3ST2Q9Y278 367 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 MYADML2A6NDP7 307 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 H3BMQ9 156 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 M0R2Z0 102 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 EDF1O60869 148 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 FKBP6O75344 327 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 SNAPC5O75971 98 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 IGKV5-2P06315 115 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 RPL3P39023 403 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 TSFMP43897 325 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 S100A10P60903 97 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 NECTIN1Q15223 517 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 SYTL3Q4VX76 610 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 SLC35E3Q7Z769 313 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 AMIGO2Q86SJ2 522 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 STPG3Q8N7X2 389 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 GALNT14Q96FL9 552 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 ZNF681Q96N22 645 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 Q9UF83 564 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 COX11Q9Y6N1 276 aa5.92□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 G3V2L1 256 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 SAP18O00422 153 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 LALBAP00709 142 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 PMP2P02689 132 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 SSR4P51571 173 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 RPS14P62263 151 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 DEFA5Q01523 94 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 IFITM3Q01628 133 aa5.91□□□□□ -1.46
RRN3-202ENST00000327307 UNC119Q13432 240 aa5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms