RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297354.6

SBSPON-201, Transcript of somatomedin B and thrombospondin type 1 domain containing, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBSPON, Length 3,801 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSPON-201ENST00000297354 EGLN1Q9GZT9 426 aa14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 DOCK7Q96N67 2140 aa14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 PLXNA3P51805 1871 aa14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 HTTP42858 3142 aa14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 PLPP3O14495 311 aa14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 CHST1O43916 411 aa14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 DDAH2O95865 285 aa14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 SRP19P09132 144 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 GLIPR1P48060 266 aa14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 C9J4A7 227 aa14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 HERPUD1Q15011 391 aa14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 FAM166AQ6J272 317 aa14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 LINC00114Q6XXX2 140 aa14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SBSPON-201ENST00000297354 ANKUB1A6NFN9 424 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 SIAH2O43255 324 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 AMBPP02760 352 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 PNLIPP16233 465 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 CLDN17P56750 224 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 FOXK1P85037 733 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 PRAMEF20Q5VT98 475 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 LILRA6Q6PI73 481 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 OR4X1Q8NH49 305 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 METTL9Q9H1A3 318 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 SLC25A22Q9H936 323 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 MFAP5Q13361 173 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 SSX7Q7RTT5 188 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 ERASQ7Z444 233 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 OR51B6Q9H340 312 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 IGHG1P01857 330 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 NPSP0C0P6 89 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 EGR1P18146 543 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.64□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 MT-ATP6P00846 226 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 BGLAPP02818 100 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 CD55P08174 381 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 FAM78BQ5VT40 261 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 GRINAQ7Z429 371 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 OR1K1Q8NGR3 316 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 OR51I2Q9H344 312 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 KIAA1456Q9P272 454 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 V9GYS6 101 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 HSPB2A8KAH6 182 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 GZMBP10144 247 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 GPR3P46089 330 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 OR3A1P47881 315 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 HSPB2Q16082 182 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 VPS25Q9BRG1 176 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 FSTP19883 344 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 ZXDAP98168 799 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 ROM1Q03395 351 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 MALLQ13021 153 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 LHX8Q68G74 356 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 OR13H1Q8NG92 308 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 MVB12AQ96EY5 273 aa14.63□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 A0A1B0GUS0 222 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 PATE4P0C8F1 98 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 PTTG1IPP53801 180 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 GFERP55789 205 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 COTL1Q14019 142 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 TK1P04183 234 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 PIGYQ3MUY2 71 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 TMEM252Q8N6L7 170 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 LMX1AQ8TE12 382 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 SNHG12Q9BXW3 62 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 CD300LBA8K4G0 201 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.62□□□□□ -0.07
SBSPON-201ENST00000297354 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms