RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291547.9

PKNOX1-201, Transcript of PBX/knotted 1 homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKNOX1, Length 5,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.57□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.57□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.57□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.57□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 C4orf45Q96LM5 186 aa9.57□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 NAA60Q9H7X0 242 aa9.57□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.57□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.57□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 SIT1Q9Y3P8 196 aa9.57□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF716A6NP11 495 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 ADAP1O75689 374 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 MELTFP08582 738 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 IRF3Q14653 427 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 Q56UQ5 140 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 MISP3Q96FF7 219 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 RNF2Q99496 336 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 AMDHD2Q9Y303 409 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 CDRT15L2A8MXV6 281 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 GNG3P63215 75 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 FDX2Q6P4F2 183 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 NOXO1Q8NFA2 376 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 OR10A7Q8NGE5 316 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 OR1F12Q8NHA8 337 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 ABHD1Q96SE0 405 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 OR5AC1P0C628 307 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 FOXB1Q99853 325 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 DOK5Q9P104 306 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 PRSS50Q9UI38 385 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 A6NDN8 102 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 TMEM210A6NLX4 147 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 TCF21O43680 179 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 OR1C1Q15619 314 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 C6orf201Q7Z4U5 140 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 VASH2Q86V25 355 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.56□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 FRG2CA6NGY1 282 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 DEFB108AA8MXU0 73 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 HLA-GP17693 338 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 BCL3P20749 454 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 SELENOPP49908 381 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 P2RY4P51582 365 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 TRAT1Q6PIZ9 186 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 LYG1Q8N1E2 194 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 NAGKQ9UJ70 344 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 PSG11Q9UQ72 335 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 CYR61O00622 381 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 SEMA7AO75326 666 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 EPPINO95925 133 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 G6PCP35575 357 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 OR1N1Q8NGS0 311 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 RAB33BQ9H082 229 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 SLC6A13Q9NSD5 602 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 MYO7AQ13402 2215 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 F5P12259 2224 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 IGLV3-27P01718 113 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 MICBQ29980 383 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 SPINK9Q5DT21 86 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 MVB12AQ96EY5 273 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 SIRT7Q9NRC8 400 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 FUT9Q9Y231 359 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 KCNMB2Q9Y691 235 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 OR2W5A6NFC9 320 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 H3BVH4 76 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 OR10J1P30954 320 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 SLC25A1P53007 311 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 IL24Q13007 206 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 ALKBH6Q3KRA9 238 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 COX19Q49B96 90 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF391Q9UJN7 358 aa9.55□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 RAB29O14966 203 aa9.54□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.54□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 CCR2P41597 374 aa9.54□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 Q8IYB0 196 aa9.54□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 C5orf17Q8NAS9 161 aa9.54□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 OR2V1Q8NHB1 315 aa9.54□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 SARGQ9BW04 601 aa9.54□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.54□□□□□ -0.88
PKNOX1-201ENST00000291547 MMP25Q9NPA2 562 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms