RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287916.8

CLDN12-201, Transcript of claudin 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN12, Length 3,565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12-201ENST00000287916 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 DOK3Q7L591 496 aa7□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF488Q96MN9 340 aa7□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 AQP10Q96PS8 301 aa7□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 KCNK17Q96T54 332 aa7□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 SYT3Q9BQG1 590 aa7□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 CABLES2Q9BTV7 478 aa7□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 OPA3Q9H6K4 179 aa7□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 LAMP3Q9UQV4 416 aa7□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 BTBD17A6NE02 478 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 EFNA2O43921 213 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 WDR1O75083 606 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 DEDDO75618 318 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 CD33P20138 364 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 S100A12P80511 92 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 MALLQ13021 153 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 SMIM8Q96KF7 97 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 LURAP1Q96LR2 239 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 LIME1Q9H400 295 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 TINAGQ9UJW2 476 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 OBSL1O75147 1896 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 GTF3C1Q12789 2109 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 LIPT2A6NK58 231 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 F8VVB4 439 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 F8VWA3 439 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 TSTD3H0UI37 97 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 IFNL4K9M1U5 179 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 DUX1O43812 170 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 CHST1O43916 411 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 TIAF1O95411 115 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 IFNA5P01569 189 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 CLPSP04118 112 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 NDUFB7P17568 137 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 EGR1P18146 543 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 SCAND1P57086 179 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 THEM4Q5T1C6 240 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 BTNL8Q6UX41 500 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 OR2C3Q8N628 320 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 Q8WTZ3 238 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 TP53RKQ96S44 253 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 PARP11Q9NR21 331 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 SHISA7A6NL88 538 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 TAAR5O14804 337 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 LDLRAD4O15165 306 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 SCRG1O75711 98 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 UBE2G2P60604 165 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 DTX1Q86Y01 620 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 NOXO1Q8NFA2 376 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.99□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 SPINK4O60575 86 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 TSPAN2O60636 221 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 FSTP19883 344 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 NPBWR2P48146 333 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 LBX1P52954 281 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 ERVFRD-1P60508 538 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 NAAAQ02083 359 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 RTP5Q14D33 572 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 LPAL2Q16609 132 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF611Q8N823 705 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 NTNG2Q96CW9 530 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 NAA60Q9H7X0 242 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 A0A1B0GX78 115 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 TUSC2O75896 110 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 HYAL1Q12794 435 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 GJC3Q8NFK1 279 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 SPTSSAQ969W0 71 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 FAM210BQ96KR6 192 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 APC2O95996 2303 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 A0A1W2PPC4 97 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 NRASP01111 189 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 TK1P04183 234 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 IGKV3-11P04433 115 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 SOD3P08294 240 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN12-201ENST00000287916 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms