RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255304.8

USPL1-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USPL1, Length 3,814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1-201ENST00000255304 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 HACD4Q5VWC8 232 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 DOK5Q9P104 306 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 A0A0J9YW62 118 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 A0A1W2PR77 199 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 K7EPK0 472 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 PPP1R2P9O14990 202 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SMIM10L1P0DMW3 83 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 OR5H8P0DN80 308 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 DOK3Q7L591 496 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 RNF128Q8TEB7 428 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SMIM10Q96HG1 83 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 UPK3AO75631 287 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 OR2F2O95006 317 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 WNT11O96014 354 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 MT-ND4LP03901 98 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 IL5P05113 134 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 BMP5P22003 454 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 CA6P23280 308 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 GNG10P50151 68 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 PCBD1P61457 104 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 CFHR1Q03591 330 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 OR2F1Q13607 317 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 EMC4Q5J8M3 183 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ZNF488Q96MN9 340 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 OPA3Q9H6K4 179 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.69□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 LIPT2A6NK58 231 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ZNF732B4DXR9 585 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 UBE2CO00762 179 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 KIR3DL2P43630 455 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SULT1A1P50225 295 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 MICBQ29980 383 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 FHL5Q5TD97 284 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ASB5Q8WWX0 329 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SEC11CQ9BY50 192 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ETV7Q9Y603 341 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 XRCC3O43542 346 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 CST7O76096 145 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 BPNT1O95861 308 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 PET100P0DJ07 73 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 COX5BP10606 129 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 RAC2P15153 192 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 HAGHQ16775 308 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 MIDNQ504T8 468 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 PMS2CLQ68D20 193 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 KMT5CQ86Y97 462 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 NECAP1Q8NC96 275 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SNX22Q96L94 193 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 GFI1Q99684 422 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TIMP4Q99727 224 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 C3orf80F5H4A9 247 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TRGC2P03986 189 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SELEP16581 610 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 PSMB6P28072 239 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TAS2R60P59551 318 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 BDH1Q02338 343 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 HIKESHIQ53FT3 197 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SPINK9Q5DT21 86 aa6.68□□□□□ -1.34
USPL1-201ENST00000255304 SLC43A2Q8N370 569 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.1 ms