RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 OR2B8PP59922 312 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 H3F3AP84243 136 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 VASH2Q86V25 355 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 ZIC4Q8N9L1 334 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 OR2G3Q8NGZ4 309 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 TM2D1Q9BX74 207 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 KPTNQ9Y664 436 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 OR6C6A6NF89 314 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 PDCD6O75340 191 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 SPINK14Q6IE38 97 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 TCEAL6Q6IPX3 200 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 OR56B2PQ8NGI1 322 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 EXTL1Q92935 676 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 WDR54Q9H977 334 aa16.01■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 K7ESF4 209 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 NPBWR2P48146 333 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 DPPA2Q7Z7J5 298 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 RDH5Q92781 318 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 SUCNR1Q9BXA5 334 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 SH3BGRL3Q9H299 93 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 LIAT1Q6ZQX7 453 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 C5orf24Q7Z6I8 188 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 GPR37O15354 613 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 RPS2P15880 293 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 HNF4GQ14541 408 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 LINC00696Q6ZRV3 163 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 SKA3Q8IX90 412 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 SLC35G3Q8N808 338 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 OR51H1Q8NH63 302 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 OR2H1Q9GZK4 316 aa16■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 TRAV20A0A0B4J274 112 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 TRAPPC2LH3BP13 241 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 SYNGR4O95473 234 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 CTSSP25774 331 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 ACER2Q5QJU3 275 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 DCAF12Q5T6F0 453 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 MKXQ8IYA7 352 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 RHBDD1Q8TEB9 315 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 IMMP1LQ96LU5 166 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 C19orf12Q9NSK7 152 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 R4GN57 208 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 PMS2P1A4D2B8 440 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 H3BP45 60 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 GPR137BO60478 399 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 ARG1P05089 322 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 MLF1P58340 268 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 PLP2Q04941 152 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 ZNF100Q8IYN0 542 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 SUMF2Q8NBJ7 301 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 C10orf35Q96D05 121 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 LRFN1Q9P244 771 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 FGF5P12034 268 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 CHATP28329 748 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 SRD5A2P31213 254 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 HGFACQ04756 655 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 SOHLH1Q5JUK2 328 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 CMTM1Q8IZ96 169 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 FGFBP3Q8TAT2 258 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 M1APQ8TC57 530 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 SMIM8Q96KF7 97 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 PARP11Q9NR21 331 aa15.99■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 CST2P09228 141 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 RD3LP0DJH9 198 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 HAGHQ16775 308 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 UBALD1Q8TB05 177 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 CPT1CQ8TCG5 803 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 LIME1Q9H400 295 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 NKX2-6A6NCS4 301 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 CDRT15L2A8MXV6 281 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 ARF1P84077 181 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 AWAT1Q58HT5 328 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 PPYP01298 95 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 CD63P08962 238 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 ABHD17BQ5VST6 288 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 CALHM1Q8IU99 346 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 IP6K3Q96PC2 410 aa15.98■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 PQLC2LA1A4F0 135 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 SYNGR3O43761 229 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 IGKV1D-12P01611 117 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 DTYMKP23919 212 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 KCNE4Q8WWG9 221 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 SPIN2AQ99865 258 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 NIT2Q9NQR4 276 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 SLC7A10Q9NS82 523 aa15.97■□□□□ 0.15
LRP3-201ENST00000253193 CEACAM18A8MTB9 384 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms