RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219476.7

TSC2-201, Transcript of TSC complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene TSC2, Length 6,156 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2-201ENST00000219476 TCL1AP56279 114 aa14.73□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 ERVFRD-1P60508 538 aa14.73□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 KLRB1Q12918 225 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 TMEM78Q5T7P6 136 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 SPINK14Q6IE38 97 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 NT5CQ8TCD5 201 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 RAXQ9Y2V3 346 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 C3P01024 1663 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 OR4A47Q6IF82 309 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 ABHD3Q8WU67 409 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 TBX15Q96SF7 602 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 HIGD1AQ9Y241 93 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 SNRPGP15A8MWD9 76 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 ASB13Q8WXK3 278 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 AKR7A2O43488 359 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 HAND1O96004 215 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 A0A1B0GU03 582 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 GPX2P18283 190 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 ZNF137PP52743 207 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 TMPRSS3P57727 454 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 HARBI1Q96MB7 349 aa14.72□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 SRD5A2P31213 254 aa14.71□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 KISS1Q15726 138 aa14.71□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 NRG4Q8WWG1 115 aa14.71□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 MANBALQ9NQG1 85 aa14.71□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 UPK1AO00322 258 aa14.71□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 WNT1P04628 370 aa14.71□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 GALNSP34059 522 aa14.71□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 Q6ZSR9 355 aa14.71□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 FGF14Q92915 247 aa14.71□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 PRNDQ9UKY0 176 aa14.71□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.71□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 PRNTQ86SH4 94 aa14.71□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 ARRDC1Q8N5I2 433 aa14.71□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 PTP4A1Q93096 173 aa14.71□□□□□ -0.05
TSC2-201ENST00000219476 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.71□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 OR4B1Q8NGF8 309 aa14.71□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 GSX2Q9BZM3 304 aa14.71□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.71□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa14.71□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa14.71□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 A0A1B0GUH1 482 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 B2MP61769 119 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 OR52B4Q8NGK2 314 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 GABRG2P18507 467 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 BTF3P20290 206 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 C1QBP02746 253 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 ZNF735P0CB33 412 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 NTMQ9P121 344 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 FAM106AQ4KMX7 169 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 FCMRO60667 390 aa14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 C3AR1Q16581 482 aa14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 CLDN34H7C241 214 aa14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 PLAUP00749 431 aa14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 GABRB1P18505 474 aa14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 OTOSQ8NHW6 89 aa14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 LPAR5Q9H1C0 372 aa14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 WSB1Q9Y6I7 421 aa14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 EMP1P54849 157 aa14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 MYO10Q9HD67 2058 aa14.69□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 GUCA2AQ02747 115 aa14.68□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 GCSAMLQ5JQS6 135 aa14.68□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 STPG3Q8N7X2 389 aa14.68□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 STXBP6Q8NFX7 210 aa14.68□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 RPS4Y2Q8TD47 263 aa14.68□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 LHX9Q9NQ69 397 aa14.68□□□□□ -0.06
TSC2-201ENST00000219476 PIPOXQ9P0Z9 390 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms