RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pld6Q5SWZ9 221 aa11.15□□□□□ -0.62
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr24Q8VFM9 313 aa11.15□□□□□ -0.62
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp959Q91VM8 539 aa11.15□□□□□ -0.62
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hist2h2abQ64522 130 aa11.15□□□□□ -0.62
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arl6ip1Q9JKW0 203 aa11.15□□□□□ -0.62
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cln8Q9QUK3 288 aa11.15□□□□□ -0.62
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mmp27D3YV89 551 aa11.15□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3543D3Z235 184 aa11.15□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tlx3O55144 291 aa11.15□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rasl12Q08AT1 266 aa11.15□□□□□ -0.63
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mfsd4b1Q8VCV9 425 aa11.15□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pttg1Q9CQJ7 199 aa11.15□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trappc6bQ9D289 158 aa11.15□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prg4Q9JM99 1054 aa11.15□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Serinc1Q9QZI8 453 aa11.15□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Heatr1G3X9B1 2143 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcrg-V5A0A0G2JGV5 113 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 KantrA0A1W2P7I0 76 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17677B3GLJ5 116 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr557E9Q550 322 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21761J3QK00 171 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3633L7N233 213 aa11.14□□□□□ -0.63
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bcl2l15Q08ED0 167 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A4gntQ14BT6 341 aa11.14□□□□□ -0.63
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mob3cQ8BJG4 216 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GnalQ8CGK7 381 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srsf4Q8VE97 489 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NubplQ9CWD8 319 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elovl7Q9D2Y9 281 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Actl6aQ9Z2N8 429 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CenpeQ6RT24 2474 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eml6Q5SQM0 1958 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-78A0A0G2JGN3 117 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nkx6-2D3Z4R4 277 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp229E9PWT2 705 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21970F6XX07 295 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bbip1J3QMK2 67 aa11.14□□□□□ -0.63
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccl20O89093 97 aa11.14□□□□□ -0.63
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hbb-bh1P04444 147 aa11.14□□□□□ -0.63
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