RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ASB13	Q8WXK3	278 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	VCAN	P13611	3396 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF732	B4DXR9	585 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	SIRPB1	O00241	398 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	EFNA2	O43921	213 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	CLPS	P04118	112 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	CSRP2	Q16527	193 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	C3AR1	Q16581	482 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	SPINK14	Q6IE38	97 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF709	Q8N972	641 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	MED13L	Q71F56	2210 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ADAM20	O43506	726 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	CLDN1	O95832	211 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	KMT5C	Q86Y97	462 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ACACA	Q13085	2346 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1B0GTI1	187 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	NPIPB7	O75200	414 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	CBR3	O75828	277 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	AADAC	P22760	399 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF266	Q14584	549 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	TSC22D1	Q15714	1073 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	OR10D3	Q8NH80	312 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	LHX6	Q9UPM6	363 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A1W2PQM1	296 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	PRSS44	E7EML9	344 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	GLUL	P15104	373 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ARG2	P78540	354 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	IGSF11	Q5DX21	431 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF488	Q96MN9	340 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	NAA60	Q9H7X0	242 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	AQP7P3	A6NL99	342 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	CD8A	P01732	235 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	FOSL2	P15408	326 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	RUNX1	Q01196	453 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ERGIC1	Q969X5	290 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525		A0A0A6YYD4	124 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	FUT3	P21217	361 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	BMP5	P22003	454 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	GHRL	Q9UBU3	117 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	TPPP	O94811	219 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	EXT1	Q16394	746 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	RNF126	Q9BV68	326 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	IL2RG	P31785	369 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	PTAFR	P25105	342 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ZP4	Q12836	540 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ADIRF	Q15847	76 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	FRZB	Q92765	325 aa		10.27	□□□□□ -0.76

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