RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636331.1

LINC00854-216, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene LINC00854, Length 718 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-216	ENST00000636331	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331		A0A1B0GTI1	187 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	C17orf98	A8MV24	154 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	DLGAP1	O14490	977 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ENTPD6	O75354	484 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ZNF737	O75373	536 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	IGLL1	P15814	213 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ROM1	Q03395	351 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	KLHL22	Q53GT1	634 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ZNF626	Q68DY1	528 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	TMEM42	Q69YG0	159 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	RASL12	Q9NYN1	266 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		11.61	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ACOD1	A6NK06	481 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	KRT8	P05787	483 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	CD24	P25063	80 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	MPZ	P25189	248 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	EDDM3B	P56851	147 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	LOXL3	P58215	753 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	CXCR4	P61073	352 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ERVK11-1	P61568	191 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	MED21	Q13503	144 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	EDDM3A	Q14507	147 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ODF4	Q2M2E3	257 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	SSX6	Q7RTT6	188 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	REC114	Q7Z4M0	266 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	RNFT2	Q96EX2	444 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331		V9GYS6	101 aa		11.6	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	DAPL1	A0PJW8	107 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	TMEM82	A0PJX8	343 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331		K7N7A8	449 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	MMP23A	O75900	390 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	MPIG6B	O95866	241 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	IGHA1	P01876	353 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ZNF728	P0DKX0	622 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	GABRB1	P18505	474 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ZNF91	Q05481	1191 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	RAB40B	Q12829	278 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ZNF573	Q86YE8	665 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	ITFG2	Q969R8	447 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	SLAMF9	Q96A28	289 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	CHST6	Q9GZX3	395 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		11.59	□□□□□ -0.55
LINC00854-216	ENST00000636331		A0A1W2PPH5	198 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	FAM172BP	A6NC97	362 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331		K7EIL1	84 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	F2RL2	O00254	374 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	XPNPEP2	O43895	674 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	APOL3	O95236	402 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	CALCB	P10092	127 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	ATP6V1B1	P15313	513 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	VHL	P40337	213 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	ACTA2	P62736	377 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	ACTG2	P63267	376 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		11.58	□□□□□ -0.56
LINC00854-216	ENST00000636331	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56

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