RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	RFT1	Q96AA3	541 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	ADI1	Q9BV57	179 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	CLN6	Q9NWW5	311 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	PF4	P02776	101 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	KRT8	P05787	483 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	PRKACA	P17612	351 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	PEX2	P28328	305 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	GDNF	P39905	211 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	FUT6	P51993	359 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	SCN1B	Q07699	218 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	FAHD1	Q6P587	224 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	RNF144B	Q7Z419	303 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM163	Q8TC26	289 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	MYDGF	Q969H8	173 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	ITFG2	Q969R8	447 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	BORCS8	Q96FH0	119 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	KRT84	Q9NSB2	600 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	GYG2	O15488	501 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	HTR1D	P28221	377 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	KRTAP10-11	P60412	298 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	EFNB1	P98172	346 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	TP53I3	Q53FA7	332 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	UTF1	Q5T230	341 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078		Q6ZSR3	168 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	POMP	Q9Y244	141 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	METTL15	A6NJ78	407 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	ZAR1L	A6NP61	321 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	SERPINA3	P01011	423 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	RBP4	P02753	201 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	VSIG8	P0DPA2	414 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	CCL1	P22362	96 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	OR3A1	P47881	315 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	GLIPR1	P48060	266 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	DYNLT3	P51808	116 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	MTCP1	P56278	107 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF91	Q05481	1191 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	AES	Q08117	197 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	C12orf73	Q69YU5	71 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	FGGY	Q96C11	551 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	SPACA5	Q96QH8	159 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	GNG8	Q9UK08	70 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TCF4-262	ENST00000628078	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078		G3V2T6	193 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	MGST3	O14880	152 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	ENTPD6	O75354	484 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	FAM107A	O95990	144 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV3-7	P01780	117 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	CDK2	P24941	298 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	ATP6V1E1	P36543	226 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	KIR3DL2	P43630	455 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	ATP1B3	P54709	279 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	NRBF2	Q96F24	287 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	MNT	Q99583	582 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	DPM3	Q9P2X0	92 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TCF4-262	ENST00000628078	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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