RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NECAP2Q9NVZ3 263 aa10.18□□□□□ -0.78
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SP9P0CG40 484 aa10.17□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF728P0DKX0 622 aa10.17□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DUSP1P28562 367 aa10.17□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPM6AP51674 278 aa10.17□□□□□ -0.78
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DUX4L4P0CJ87 422 aa10.17□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DUX4L5P0CJ88 424 aa10.17□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DUX4L6P0CJ89 424 aa10.17□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DUX4L7P0CJ90 424 aa10.17□□□□□ -0.78
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDSS1Q5T2R2 415 aa10.17□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DHRS11Q6UWP2 260 aa10.17□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LYZL2Q7Z4W2 148 aa10.17□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLAMF9Q96A28 289 aa10.17□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPHA2Q96T91 129 aa10.17□□□□□ -0.78
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DUX4Q9UBX2 424 aa10.17□□□□□ -0.78
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCA11PQ4W5N1 156 aa10.17□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM164Q5U3C3 297 aa10.17□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR5T2Q8NGG2 359 aa10.17□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa10.17□□□□□ -0.78
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 XRCC2O43543 280 aa10.16□□□□□ -0.78
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 B4GALT7Q9UBV7 327 aa10.16□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STARD10Q9Y365 291 aa10.16□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CACNA1DQ01668 2161 aa10.16□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MED12LQ86YW9 2145 aa10.16□□□□□ -0.78
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM74A3Q4VXF1 159 aa10.16□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COLCA1Q6ZS62 124 aa10.16□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF141Q8WVD5 230 aa10.16□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPSB4Q96A44 273 aa10.16□□□□□ -0.78
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRDM14Q9GZV8 571 aa10.16□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HRH4Q9H3N8 390 aa10.16□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIGMQ9H3S5 423 aa10.16□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF391Q9UJN7 358 aa10.16□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LIPGQ9Y5X9 500 aa10.16□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa10.16□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MGAQ8IWI9 3026 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR31O00270 319 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ABCD4O14678 606 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SYNGR4O95473 234 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MT-CO3P00414 261 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 F12P00748 615 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FUT3P21217 361 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRDX4Q13162 271 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa10.15□□□□□ -0.78
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HPSE2Q8WWQ2 592 aa10.15□□□□□ -0.78
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