RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602498.1

HCG18-243, Transcript of HLA complex group 18, human

TSL 3 BASIC

Gene HCG18, Length 327 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCG18-243	ENST00000602498	CHST1	O43916	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF737	O75373	536 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	NDUFA7	O95182	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TSPAN15	O95858	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CHRM2	P08172	466 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	HCK	P08631	526 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF44	P15621	663 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	MPZ	P25189	248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	GABRA5	P31644	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	GDNF	P39905	211 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR3A1	P47881	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	RBP2	P50120	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	DLX6	P56179	175 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	LGALS4	P56470	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ISL1	P61371	349 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ACTC1	P68032	377 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ACTA1	P68133	377 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	DEFA6	Q01524	100 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	AES	Q08117	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	IL18R1	Q13478	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SSX2	Q16385	188 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OCLN	Q16625	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	MIDN	Q504T8	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	XAF1	Q6GPH4	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	KRT74	Q7RTS7	529 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TCF23	Q7RTU1	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PKIB	Q9C010	78 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498		A0A1W2PPH5	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498		E9PQ18	207 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZFPL1	O95159	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR2H2	O95918	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CYB5A	P00167	134 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF728	P0DKX0	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PRKACB	P22694	351 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PEX2	P28328	305 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	GLIPR1	P48060	266 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ETV1	P50549	477 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PROK1	P58294	105 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ACTA2	P62736	377 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ACTG2	P63267	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TMED1	Q13445	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	GALE	Q14376	348 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	RCN1	Q15293	331 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498		Q6ZS46	218 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498		Q6ZSR3	168 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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