RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599564.5

GRAMD1A-211, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-211ENST00000599564 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 GABREP78334 506 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 FOXO1Q12778 655 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 CALHM2Q9HA72 323 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 GLRX2Q9NS18 164 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 CD55P08174 381 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 HOXB2P14652 356 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 CLRN1P58418 232 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 TLE1Q04724 770 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 NECAP1Q8NC96 275 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 CLDND2Q8NHS1 167 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 TP53RKQ96S44 253 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 EYSQ5T1H1 3165 aa14.63□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 ZNF266Q14584 549 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 PDCD1Q15116 288 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 LYZL4Q96KX0 146 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 CHST11Q9NPF2 352 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 A0A1B0GWJ7 208 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 A0A1W2PQF6 199 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 F5H5K5 113 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 IFNL4K9M1U5 179 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 TUBG1P23258 451 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 PPA1Q15181 289 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 FAM189A2Q15884 450 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 MPV17LQ2QL34 196 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 OR4X1Q8NH49 305 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 PGAM5Q96HS1 289 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.62□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 PGA3P0DJD8 388 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 DYNLT3P51808 116 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 CD81P60033 236 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 DOK3Q7L591 496 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 CMTM1Q8IZ96 169 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 LGI3Q8N145 548 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 GAB2Q9UQC2 676 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 SHISA7A6NL88 538 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 PNLIPP16233 465 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 ECI1P42126 302 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 TNFRSF9Q07011 255 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 PROB1E7EW31 1015 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 CLDN34H7C241 214 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 TNFP01375 233 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 NTSR1P30989 418 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 COL10A1Q03692 680 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 DNLZQ5SXM8 178 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 LANCL3Q6ZV70 420 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.61□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 GFERP55789 205 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 P2RY6Q15077 328 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 TMEM252Q8N6L7 170 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 MOB1AQ9H8S9 216 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 A0A1W2PQD3 144 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 OR4A8P0C604 315 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 CTSEP14091 401 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 RNF4P78317 190 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 FOXF1Q12946 379 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 ZNF154Q13106 437 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 NSDHLQ15738 373 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 FAM90A2PQ658T7 463 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 RTL10Q7L3V2 364 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 SNHG12Q9BXW3 62 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 DECR2Q9NUI1 292 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.6□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.59□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GRAMD1A-211ENST00000599564 BLACEA4D250 179 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms