RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 C14orf79Q96F83 325 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 TIMD4Q96H15 378 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC32Q9BV29 185 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 IFT22Q9H7X7 185 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 PRR13Q9NZ81 148 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.22□□□□□ -1.41
SMAD4-210ENST00000590061 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 A0A0G2JK05 382 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 CENPXA8MT69 81 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 E7EQL1 145 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 H3BSH0 61 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SH2D1BO14796 132 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 CTDSPLO15194 276 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 NXPH2O95156 264 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF205O95201 554 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 CSF3P09919 207 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MPV17P39210 176 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 INPP1P49441 399 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 DEFA1P59665 94 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 DEFA3P59666 94 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 FGF12P61328 243 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 TNK1Q13470 666 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 HFEQ30201 348 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 DTX2Q86UW9 622 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 LYPD6Q86Y78 171 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 OSR2Q8N2R0 312 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 BORCS5Q969J3 196 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 GAL3ST1Q99999 423 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SYT3Q9BQG1 590 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 TM2D1Q9BX74 207 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 GCM1Q9NP62 436 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 RNF7Q9UBF6 113 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 HSF4Q9ULV5 492 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.21□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ISPDA4D126 451 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 A6NIN4 97 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 H7C417 338 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SPRY3O43610 288 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 LMX1BO60663 402 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 CDC14BO60729 498 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 CTAG2O75638 210 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 NCR1O76036 304 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 KNG1P01042 644 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 GRPP07492 148 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 PGA5P0DJD9 388 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MGMTP16455 207 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 FUT3P21217 361 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 TNFSF8P32971 234 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MAGEB1P43366 347 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 PPP5CP53041 499 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM33P57088 247 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 OR10A3P58181 314 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 DSCR9P59020 149 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ACTBP60709 375 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ZP1P60852 638 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 ACTG1P63261 375 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SCN1BQ07699 218 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 MICBQ29980 383 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 POC1AQ8NBT0 407 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.2□□□□□ -1.42
SMAD4-210ENST00000590061 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.2□□□□□ -1.42
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