RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 OPA3Q9H6K4 179 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR173Q9NS66 373 aa21.91■■□□□ 1.1
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CAPNS1-204ENST00000587718 COMMD9Q9P000 198 aa21.91■■□□□ 1.1
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CAPNS1-204ENST00000587718 COQ8AQ8NI60 647 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-204ENST00000587718 PDCD10Q9BUL8 212 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-204ENST00000587718 AHRRA9YTQ3 701 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-204ENST00000587718 HTR3BO95264 441 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-204ENST00000587718 UBA52P62987 128 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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