RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	SSX6	Q7RTT6	188 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	NDNF	Q8TB73	568 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	SPSB1	Q96BD6	273 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	AJUBA	Q96IF1	538 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	MGST3	O14880	152 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF737	O75373	536 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	FBXO24	O75426	580 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	APOL3	O95236	402 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	DYNLT3	P51808	116 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	DLX6	P56179	175 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ACTA2	P62736	377 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ACTG2	P63267	376 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	SLC34A1	Q06495	639 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	TP53I3	Q53FA7	332 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	UTS2B	Q765I0	119 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	CFHR4	Q92496	578 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	EME1	Q96AY2	570 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	RHOF	Q9HBH0	211 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ODF3B	A8MYP8	253 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	HTR1A	P08908	422 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	PRKACA	P17612	351 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ATF1	P18846	271 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	BRS3	P32247	399 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	REC114	Q7Z4M0	266 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	C1QL4	Q86Z23	238 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	STMN2	Q93045	179 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	HHLA2	Q9UM44	414 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA3-208	ENST00000579743	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	MEGF11	A6BM72	1044 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743		A6NDX4	124 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	CHST1	O43916	411 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	ISG15	P05161	165 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	PAX6	P26367	422 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	HTR1D	P28221	377 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	CEACAM3	P40198	252 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	RAB13	P51153	203 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF91	Q05481	1191 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF146	Q15072	292 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743		Q8N2B8	174 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF596	Q8TC21	504 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	PIFO	Q8TCI5	191 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	FGGY	Q96C11	551 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	RNFT2	Q96EX2	444 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	OPALIN	Q96PE5	141 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM82	A0PJX8	343 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743		F8VVB4	439 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743		F8VWA3	439 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	SLC16A6	O15403	523 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	BCL3	P20749	454 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	CCR9	P51686	369 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	P2RX3	P56373	397 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF85	Q03923	595 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	FDX2	Q6P4F2	183 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	RDH10	Q8IZV5	341 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	CHST4	Q8NCG5	386 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	CHST6	Q9GZX3	395 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF702P	Q9H963	129 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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