RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 MDH2P40926 338 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 CLDN6P56747 220 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 TAS2R31P59538 309 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 DEFA1P59665 94 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 DEFA3P59666 94 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 ERVFC1-1P60608 527 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 SELENOWP63302 87 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 PAFAH1B2P68402 229 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 TCF15Q12870 199 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 EBPQ15125 230 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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CAPN3-211ENST00000562199 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 FFAR4Q5NUL3 377 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 LCTLQ6UWM7 567 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa4.75□□□□□ -1.65
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CAPN3-211ENST00000562199 MSRB3Q8IXL7 192 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 ABHD12Q8N2K0 398 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF614Q8N883 585 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 TSTD1Q8NFU3 115 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 OR13C8Q8NGS7 320 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 OR4L1Q8NH43 312 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 OR5B3Q8NH48 314 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 OR4X1Q8NH49 305 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 OR14A16Q8NHC5 309 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 SLC7A6Q92536 515 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM159Q96B96 161 aa4.75□□□□□ -1.65
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CAPN3-211ENST00000562199 HYLS1Q96M11 299 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 RBP7Q96R05 134 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 ATP5SQ99766 215 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF649Q9BS31 505 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 SRMSQ9H3Y6 488 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 RETNQ9HD89 108 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM30AQ9NV96 361 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 C1orf123Q9NWV4 160 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 MED29Q9NX70 200 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 C1RLQ9NZP8 487 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 FLRT1Q9NZU1 646 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 JKAMPQ9P055 326 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 MARCH2Q9P0N8 246 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 PRO0628Q9UI54 55 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 ERG28Q9UKR5 140 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 TNFSF18Q9UNG2 199 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 TCF19Q9Y242 345 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 TMED7Q9Y3B3 224 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 SIT1Q9Y3P8 196 aa4.75□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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CAPN3-211ENST00000562199 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1B0GX78 115 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 MYBPHLA2RUH7 354 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 H0YL77 283 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 K7ESM1 405 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 CCL22O00626 93 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 XRCC3O43542 346 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 ICOSLGO75144 302 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 SEMG1P04279 462 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 CRYGDP07320 174 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 UCHL1P09936 223 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 ESDP10768 282 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 PRKACGP22612 351 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 HTR1DP28221 377 aa4.74□□□□□ -1.65
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CAPN3-211ENST00000562199 NSG1P42857 185 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 GZMMP51124 257 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 SGSHP51688 502 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 TAS2R30P59541 319 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 RAB8AP61006 207 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 LSM3P62310 102 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 RHOGP84095 191 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 RUNX1Q01196 453 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 IL10RBQ08334 325 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF763Q0D2J5 394 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 KLRB1Q12918 225 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 FOXL1Q12952 345 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 VGLL4Q14135 290 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 HIST3H3Q16695 136 aa4.74□□□□□ -1.65
CAPN3-211ENST00000562199 CCSMST1Q4G0I0 132 aa4.74□□□□□ -1.65
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