RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965		A0A0G2JK05	382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965		A6NIN4	97 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965		A6NLC8	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CLDN25	C9JDP6	229 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CDIPT	O14735	213 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	LMX1B	O60663	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CA11	O75493	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	NCR1	O76036	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	KNG1	P01042	644 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	APOA1	P02647	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CHRM2	P08172	466 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	DAO	P14920	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	GLRA1	P23415	457 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	GIF	P27352	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PMEL	P40967	661 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	MAGEB1	P43366	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	NPY4R	P50391	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FGF12	P61328	243 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CCL8	P80075	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PAX5	Q02548	391 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF146	Q15072	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF404	Q494X3	552 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CALHM1	Q8IU99	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SPIC	Q8N5J4	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	RAB1C	Q92928	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ABCG5	Q9H222	651 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	OOEP	A6NGQ2	149 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965		H0YL77	283 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965		H3BSH0	61 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965		H7C1Q1	480 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	LGALS8	O00214	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	RP2	O75695	350 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	NXPH2	O95156	264 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	CSN2	P05814	226 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	HEXA	P06865	529 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	GRP	P07492	148 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	SLC25A16	P16260	332 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	LMO1	P25800	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	S100A5	P33763	92 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	TALDO1	P37837	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	NR4A2	P43354	598 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	PTH2R	P49190	550 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	POU3F4	P49335	361 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	PDLIM4	P50479	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	ATP5J2	P56134	94 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	BTG1	P62324	171 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	MXD1	Q05195	221 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	SPCS2	Q15005	226 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	P2RY14	Q15391	338 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	IDNK	Q5T6J7	187 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	SHE	Q5VZ18	495 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CHP1-208	ENST00000560965	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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