RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558285.5

USP3-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-208ENST00000558285 IRF3Q14653 427 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP3-208ENST00000558285 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP3-208ENST00000558285 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
USP3-208ENST00000558285 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.27□□□□□ -1.25
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USP3-208ENST00000558285 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.251e-6■■■■□ 20.5
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USP3-208ENST00000558285 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP3-208ENST00000558285 AKAP9Q99996 3911 aa7.26□□□□□ -1.25
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