RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 IGLV1-44P01699 117 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 ZNF44P15621 663 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 FUT3P21217 361 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 RAG2P55895 527 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 MPPED2Q15777 294 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 LIN54Q6MZP7 749 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 ASCL4Q6XD76 172 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 RND1Q92730 232 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 CA10Q9NS85 328 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 VSIG4Q9Y279 399 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 OR5B21A6NL26 309 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 C16orf97H3BN30 126 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 OR4E1P0C645 316 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 MSMPQ1L6U9 139 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 WDR13Q9H1Z4 485 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 OR51I2Q9H344 312 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 PLSCR3Q9NRY6 295 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 ESPL1Q14674 2120 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 MLNRO43193 412 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 NXPH2O95156 264 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 KNG1P01042 644 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 CCKARP32238 428 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 FGF12P61328 243 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 KLRB1Q12918 225 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 ARL6IP1Q15041 203 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 NOXA1Q86UR1 476 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 TMEM17Q86X19 198 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 HOGA1Q86XE5 327 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 FAM58AQ8N1B3 248 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 OR8G5Q8NG78 346 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 TERB2Q8NHR7 220 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 PPA2Q9H2U2 334 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 AKAP6Q13023 2319 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 TRAV39A0A0B4J263 110 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 J3QW42 95 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 PRAF2O60831 178 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 TFF1P04155 84 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 ANXA3P12429 323 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 PGAM2P15259 253 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 FXYD4P59646 89 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 Q5BKY6 102 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 CD276Q5ZPR3 534 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 Q6ZR03 302 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 TOMM40LQ969M1 308 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 PRR13Q9NZ81 148 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 IL36GQ9NZH8 169 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.17□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 SIRPB1O00241 398 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 WNT9BO14905 357 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 FCGR3AP08637 254 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 CBX5P45973 191 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 IL13RA1P78552 427 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 DHRS2Q13268 280 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 ZNF626Q68DY1 528 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 SLC22A25Q6T423 547 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 PRR18Q8N4B5 295 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 TREM2Q9NZC2 230 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-215ENST00000549143 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms