RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 ABHD14BQ96IU4 210 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 DMRTA2Q96SC8 542 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 PRRX2Q99811 253 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.46□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 PQLC2LA1A4F0 135 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 TMEM218A2RU14 115 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 OR5B21A6NL26 309 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 MASP2O00187 686 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 GPR137BO60478 399 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 MT-CO3P00414 261 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 PLATP00750 562 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 IGKV1D-12P01611 117 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 SP9P0CG40 484 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 HKR1P10072 659 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 CD46P15529 392 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 S100GP29377 79 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 FCGR2CP31995 323 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 OPRM1P35372 400 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 RND3P61587 244 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 PRDX4Q13162 271 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 BTN1A1Q13410 526 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 ZNF273Q14593 569 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 TMEM187Q14656 261 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 PIGYQ3MUY2 71 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 SPINK14Q6IE38 97 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 COMMD1Q8N668 190 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 TMEM105Q8N8V8 129 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 OR56B2PQ8NGI1 322 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 TOMM40LQ969M1 308 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 LRRC46Q96FV0 321 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 ACKR4Q9NPB9 350 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 MPC1Q9Y5U8 109 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 TRIOO75962 3097 aa8.45□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 LRP5LA4QPB2 252 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 MSGN1A6NI15 193 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 TRAPPC2LH3BP13 241 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 M0R296 226 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 TSPAN4O14817 238 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 NME2P1O60361 137 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 ATG12O94817 140 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 CDS2O95674 445 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 TK1P04183 234 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 OR5AC1P0C628 307 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 PATE4P0C8F1 98 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 NME2P22392 152 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 IL32P24001 234 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 CD82P27701 267 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 APLNRP35414 380 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 P2RY1P47900 373 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 SULT1A2P50226 295 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 RAB5CP51148 216 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 DEFA5Q01523 94 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 SLC25A26Q70HW3 274 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 ZNF573Q86YE8 665 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 ZNF565Q8N9K5 539 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 FGFBP3Q8TAT2 258 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 TMED6Q8WW62 240 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 EXTL1Q92935 676 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 SMIM8Q96KF7 97 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 C18orf12Q96KH6 178 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CS-205ENST00000546891 CALHM2Q9HA72 323 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms